Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT3P49368 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT3P49368 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT3P49368 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT3P49368 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCT3P49368 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCT3P49368 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCT3P49368 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCT3P49368 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCT3P49368 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCT3P49368 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCT3P49368 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCT3P49368 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT3P49368 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT3P49368 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT3P49368 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT3P49368 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT3P49368 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT3P49368 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT3P49368 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT3P49368 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT3P49368 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT3P49368 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT3P49368 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCT3P49368 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCT3P49368 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCT3P49368 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCT3P49368 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCT3P49368 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCT3P49368 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT3P49368 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT3P49368 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT3P49368 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT3P49368 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT3P49368 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT3P49368 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT3P49368 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT3P49368 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT3P49368 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT3P49368 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT3P49368 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT3P49368 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT3P49368 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT3P49368 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT3P49368 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT3P49368 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT3P49368 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT3P49368 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT3P49368 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT3P49368 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT3P49368 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT3P49368 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT3P49368 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT3P49368 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT3P49368 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT3P49368 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT3P49368 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT3P49368 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT3P49368 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCT3P49368 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCT3P49368 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCT3P49368 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT3P49368 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT3P49368 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT3P49368 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT3P49368 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT3P49368 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT3P49368 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT3P49368 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT3P49368 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT3P49368 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT3P49368 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCT3P49368 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCT3P49368 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCT3P49368 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCT3P49368 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCT3P49368 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCT3P49368 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCT3P49368 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCT3P49368 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCT3P49368 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCT3P49368 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCT3P49368 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCT3P49368 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT3P49368 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT3P49368 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT3P49368 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT3P49368 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT3P49368 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCT3P49368 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCT3P49368 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCT3P49368 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCT3P49368 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCT3P49368 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCT3P49368 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT3P49368 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT3P49368 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT3P49368 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT3P49368 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT3P49368 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms