Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CX3CR1P49238 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CX3CR1P49238 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CX3CR1P49238 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.9 ms