Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGM4P49221 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGM4P49221 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGM4P49221 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGM4P49221 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGM4P49221 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGM4P49221 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGM4P49221 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGM4P49221 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGM4P49221 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGM4P49221 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGM4P49221 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGM4P49221 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGM4P49221 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGM4P49221 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGM4P49221 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGM4P49221 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGM4P49221 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGM4P49221 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGM4P49221 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGM4P49221 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGM4P49221 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGM4P49221 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGM4P49221 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGM4P49221 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGM4P49221 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGM4P49221 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGM4P49221 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGM4P49221 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGM4P49221 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGM4P49221 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGM4P49221 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGM4P49221 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGM4P49221 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGM4P49221 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TGM4P49221 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGM4P49221 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TGM4P49221 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TGM4P49221 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TGM4P49221 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGM4P49221 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGM4P49221 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGM4P49221 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGM4P49221 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TGM4P49221 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TGM4P49221 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGM4P49221 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGM4P49221 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGM4P49221 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGM4P49221 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGM4P49221 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGM4P49221 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGM4P49221 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGM4P49221 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGM4P49221 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGM4P49221 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGM4P49221 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGM4P49221 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGM4P49221 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGM4P49221 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGM4P49221 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGM4P49221 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGM4P49221 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGM4P49221 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGM4P49221 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TGM4P49221 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TGM4P49221 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGM4P49221 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGM4P49221 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGM4P49221 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGM4P49221 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGM4P49221 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGM4P49221 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGM4P49221 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGM4P49221 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGM4P49221 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGM4P49221 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGM4P49221 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGM4P49221 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGM4P49221 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGM4P49221 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGM4P49221 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGM4P49221 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGM4P49221 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGM4P49221 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGM4P49221 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGM4P49221 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGM4P49221 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGM4P49221 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGM4P49221 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGM4P49221 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGM4P49221 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGM4P49221 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGM4P49221 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGM4P49221 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGM4P49221 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGM4P49221 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGM4P49221 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGM4P49221 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGM4P49221 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms