Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SLC4A3P48751 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SLC4A3P48751 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SLC4A3P48751 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SLC4A3P48751 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SLC4A3P48751 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SLC4A3P48751 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SLC4A3P48751 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SLC4A3P48751 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SLC4A3P48751 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SLC4A3P48751 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SLC4A3P48751 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SLC4A3P48751 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SLC4A3P48751 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
SLC4A3P48751 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SLC4A3P48751 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
SLC4A3P48751 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SLC4A3P48751 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SLC4A3P48751 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
SLC4A3P48751 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SLC4A3P48751 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SLC4A3P48751 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SLC4A3P48751 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SLC4A3P48751 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SLC4A3P48751 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SLC4A3P48751 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SLC4A3P48751 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SLC4A3P48751 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SLC4A3P48751 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SLC4A3P48751 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLC4A3P48751 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLC4A3P48751 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLC4A3P48751 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SLC4A3P48751 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SLC4A3P48751 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SLC4A3P48751 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SLC4A3P48751 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SLC4A3P48751 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SLC4A3P48751 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SLC4A3P48751 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SLC4A3P48751 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SLC4A3P48751 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SLC4A3P48751 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SLC4A3P48751 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SLC4A3P48751 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SLC4A3P48751 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SLC4A3P48751 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SLC4A3P48751 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SLC4A3P48751 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SLC4A3P48751 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SLC4A3P48751 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SLC4A3P48751 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SLC4A3P48751 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SLC4A3P48751 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
SLC4A3P48751 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
SLC4A3P48751 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLC4A3P48751 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLC4A3P48751 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SLC4A3P48751 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SLC4A3P48751 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLC4A3P48751 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SLC4A3P48751 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SLC4A3P48751 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SLC4A3P48751 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SLC4A3P48751 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SLC4A3P48751 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SLC4A3P48751 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SLC4A3P48751 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SLC4A3P48751 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SLC4A3P48751 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SLC4A3P48751 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
SLC4A3P48751 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SLC4A3P48751 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SLC4A3P48751 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLC4A3P48751 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms