Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
KDM5CP41229 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
KDM5CP41229 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
KDM5CP41229 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
KDM5CP41229 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
KDM5CP41229 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
KDM5CP41229 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
KDM5CP41229 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
KDM5CP41229 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
KDM5CP41229 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
KDM5CP41229 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
KDM5CP41229 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
KDM5CP41229 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
KDM5CP41229 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
KDM5CP41229 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
KDM5CP41229 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
KDM5CP41229 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
KDM5CP41229 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
KDM5CP41229 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
KDM5CP41229 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
KDM5CP41229 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
KDM5CP41229 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
KDM5CP41229 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
KDM5CP41229 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
KDM5CP41229 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
KDM5CP41229 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
KDM5CP41229 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
KDM5CP41229 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
KDM5CP41229 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
KDM5CP41229 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
KDM5CP41229 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.7■■■■□ 3.95
KDM5CP41229 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
KDM5CP41229 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
KDM5CP41229 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
KDM5CP41229 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
KDM5CP41229 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
KDM5CP41229 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
KDM5CP41229 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
KDM5CP41229 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
KDM5CP41229 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
KDM5CP41229 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
KDM5CP41229 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
KDM5CP41229 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
KDM5CP41229 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
KDM5CP41229 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
KDM5CP41229 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
KDM5CP41229 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
KDM5CP41229 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
KDM5CP41229 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
KDM5CP41229 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
KDM5CP41229 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
KDM5CP41229 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
KDM5CP41229 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
KDM5CP41229 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
KDM5CP41229 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
KDM5CP41229 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
KDM5CP41229 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
KDM5CP41229 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
KDM5CP41229 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
KDM5CP41229 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
KDM5CP41229 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
KDM5CP41229 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
KDM5CP41229 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
KDM5CP41229 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
KDM5CP41229 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
KDM5CP41229 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
KDM5CP41229 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
KDM5CP41229 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
KDM5CP41229 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
KDM5CP41229 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
KDM5CP41229 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
KDM5CP41229 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
KDM5CP41229 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
KDM5CP41229 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
KDM5CP41229 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
KDM5CP41229 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
KDM5CP41229 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
KDM5CP41229 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
KDM5CP41229 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
KDM5CP41229 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
KDM5CP41229 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
KDM5CP41229 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
KDM5CP41229 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
KDM5CP41229 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
KDM5CP41229 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
KDM5CP41229 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
KDM5CP41229 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
KDM5CP41229 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
KDM5CP41229 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
KDM5CP41229 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
KDM5CP41229 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
KDM5CP41229 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
KDM5CP41229 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
KDM5CP41229 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
KDM5CP41229 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
KDM5CP41229 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
KDM5CP41229 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
KDM5CP41229 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
KDM5CP41229 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
KDM5CP41229 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms