Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPGP40121 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPGP40121 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPGP40121 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPGP40121 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPGP40121 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPGP40121 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPGP40121 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPGP40121 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPGP40121 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPGP40121 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAPGP40121 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPGP40121 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPGP40121 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPGP40121 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPGP40121 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPGP40121 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPGP40121 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPGP40121 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPGP40121 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPGP40121 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPGP40121 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPGP40121 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPGP40121 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPGP40121 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPGP40121 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPGP40121 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPGP40121 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPGP40121 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPGP40121 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPGP40121 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPGP40121 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPGP40121 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPGP40121 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPGP40121 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPGP40121 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPGP40121 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPGP40121 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPGP40121 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPGP40121 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPGP40121 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPGP40121 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPGP40121 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPGP40121 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPGP40121 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPGP40121 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPGP40121 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPGP40121 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPGP40121 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPGP40121 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPGP40121 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPGP40121 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPGP40121 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPGP40121 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPGP40121 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPGP40121 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPGP40121 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPGP40121 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPGP40121 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPGP40121 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPGP40121 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPGP40121 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPGP40121 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPGP40121 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPGP40121 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPGP40121 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAPGP40121 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPGP40121 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPGP40121 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPGP40121 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPGP40121 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPGP40121 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPGP40121 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPGP40121 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPGP40121 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPGP40121 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPGP40121 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPGP40121 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPGP40121 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPGP40121 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPGP40121 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPGP40121 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPGP40121 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPGP40121 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPGP40121 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPGP40121 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPGP40121 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPGP40121 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPGP40121 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPGP40121 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPGP40121 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPGP40121 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPGP40121 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPGP40121 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPGP40121 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPGP40121 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPGP40121 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPGP40121 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPGP40121 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPGP40121 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms