Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIPAP38571 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIPAP38571 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIPAP38571 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIPAP38571 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIPAP38571 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIPAP38571 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LIPAP38571 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LIPAP38571 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIPAP38571 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIPAP38571 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LIPAP38571 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LIPAP38571 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIPAP38571 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIPAP38571 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIPAP38571 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIPAP38571 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIPAP38571 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIPAP38571 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIPAP38571 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIPAP38571 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIPAP38571 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIPAP38571 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIPAP38571 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIPAP38571 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIPAP38571 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIPAP38571 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIPAP38571 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIPAP38571 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIPAP38571 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIPAP38571 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIPAP38571 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIPAP38571 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIPAP38571 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIPAP38571 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIPAP38571 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIPAP38571 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIPAP38571 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIPAP38571 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIPAP38571 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIPAP38571 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIPAP38571 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIPAP38571 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIPAP38571 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LIPAP38571 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIPAP38571 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIPAP38571 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIPAP38571 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIPAP38571 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPAP38571 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPAP38571 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPAP38571 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPAP38571 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPAP38571 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIPAP38571 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIPAP38571 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIPAP38571 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIPAP38571 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIPAP38571 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPAP38571 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIPAP38571 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIPAP38571 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIPAP38571 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIPAP38571 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIPAP38571 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIPAP38571 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIPAP38571 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIPAP38571 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIPAP38571 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIPAP38571 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIPAP38571 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIPAP38571 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LIPAP38571 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIPAP38571 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIPAP38571 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIPAP38571 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIPAP38571 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIPAP38571 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIPAP38571 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIPAP38571 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIPAP38571 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIPAP38571 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIPAP38571 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIPAP38571 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIPAP38571 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIPAP38571 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIPAP38571 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIPAP38571 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIPAP38571 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LIPAP38571 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIPAP38571 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIPAP38571 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIPAP38571 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIPAP38571 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIPAP38571 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LIPAP38571 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LIPAP38571 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIPAP38571 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIPAP38571 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIPAP38571 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms