Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GGCXP38435 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GGCXP38435 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GGCXP38435 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GGCXP38435 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GGCXP38435 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
GGCXP38435 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GGCXP38435 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GGCXP38435 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GGCXP38435 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GGCXP38435 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGCXP38435 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGCXP38435 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GGCXP38435 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGCXP38435 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGCXP38435 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGCXP38435 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGCXP38435 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGCXP38435 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGCXP38435 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGCXP38435 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGCXP38435 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGCXP38435 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGCXP38435 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGCXP38435 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGCXP38435 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGCXP38435 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGCXP38435 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGCXP38435 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GGCXP38435 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGCXP38435 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGCXP38435 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGCXP38435 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GGCXP38435 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GGCXP38435 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GGCXP38435 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GGCXP38435 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GGCXP38435 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GGCXP38435 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GGCXP38435 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GGCXP38435 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GGCXP38435 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GGCXP38435 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GGCXP38435 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GGCXP38435 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGCXP38435 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGCXP38435 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGCXP38435 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGCXP38435 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGCXP38435 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGCXP38435 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGCXP38435 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGCXP38435 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGCXP38435 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGCXP38435 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GGCXP38435 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GGCXP38435 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GGCXP38435 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGCXP38435 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGCXP38435 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGCXP38435 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGCXP38435 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGCXP38435 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGCXP38435 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GGCXP38435 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GGCXP38435 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GGCXP38435 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GGCXP38435 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GGCXP38435 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GGCXP38435 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GGCXP38435 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGCXP38435 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGCXP38435 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGCXP38435 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GGCXP38435 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGCXP38435 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGCXP38435 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGCXP38435 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGCXP38435 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGCXP38435 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGCXP38435 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGCXP38435 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GGCXP38435 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GGCXP38435 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGCXP38435 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGCXP38435 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GGCXP38435 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGCXP38435 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGCXP38435 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGCXP38435 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GGCXP38435 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGCXP38435 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGCXP38435 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGCXP38435 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGCXP38435 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGCXP38435 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGCXP38435 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGCXP38435 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GGCXP38435 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGCXP38435 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms