Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLCN1P35523 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLCN1P35523 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLCN1P35523 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLCN1P35523 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLCN1P35523 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLCN1P35523 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLCN1P35523 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLCN1P35523 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLCN1P35523 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CLCN1P35523 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLCN1P35523 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLCN1P35523 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLCN1P35523 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLCN1P35523 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLCN1P35523 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLCN1P35523 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLCN1P35523 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLCN1P35523 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLCN1P35523 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLCN1P35523 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLCN1P35523 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLCN1P35523 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLCN1P35523 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLCN1P35523 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLCN1P35523 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLCN1P35523 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLCN1P35523 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLCN1P35523 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLCN1P35523 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLCN1P35523 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLCN1P35523 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLCN1P35523 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLCN1P35523 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLCN1P35523 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLCN1P35523 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLCN1P35523 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLCN1P35523 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLCN1P35523 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLCN1P35523 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CLCN1P35523 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLCN1P35523 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLCN1P35523 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLCN1P35523 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLCN1P35523 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLCN1P35523 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLCN1P35523 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLCN1P35523 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLCN1P35523 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLCN1P35523 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLCN1P35523 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLCN1P35523 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLCN1P35523 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLCN1P35523 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLCN1P35523 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLCN1P35523 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLCN1P35523 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLCN1P35523 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLCN1P35523 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLCN1P35523 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLCN1P35523 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLCN1P35523 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLCN1P35523 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLCN1P35523 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLCN1P35523 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CLCN1P35523 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLCN1P35523 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CLCN1P35523 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLCN1P35523 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLCN1P35523 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLCN1P35523 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLCN1P35523 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLCN1P35523 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLCN1P35523 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLCN1P35523 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLCN1P35523 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLCN1P35523 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLCN1P35523 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLCN1P35523 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLCN1P35523 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLCN1P35523 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLCN1P35523 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLCN1P35523 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLCN1P35523 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLCN1P35523 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
CLCN1P35523 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLCN1P35523 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLCN1P35523 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLCN1P35523 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLCN1P35523 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLCN1P35523 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLCN1P35523 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLCN1P35523 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLCN1P35523 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLCN1P35523 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLCN1P35523 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CLCN1P35523 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CLCN1P35523 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLCN1P35523 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLCN1P35523 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms