Protein–RNA interactions for Protein: P34903

GABRA3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA3P34903 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRA3P34903 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRA3P34903 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRA3P34903 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRA3P34903 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRA3P34903 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRA3P34903 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRA3P34903 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRA3P34903 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRA3P34903 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRA3P34903 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRA3P34903 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRA3P34903 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRA3P34903 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRA3P34903 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRA3P34903 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRA3P34903 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRA3P34903 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRA3P34903 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRA3P34903 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRA3P34903 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRA3P34903 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRA3P34903 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRA3P34903 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRA3P34903 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRA3P34903 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRA3P34903 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRA3P34903 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRA3P34903 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRA3P34903 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRA3P34903 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRA3P34903 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRA3P34903 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRA3P34903 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRA3P34903 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRA3P34903 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRA3P34903 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRA3P34903 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRA3P34903 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRA3P34903 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GABRA3P34903 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRA3P34903 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRA3P34903 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRA3P34903 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRA3P34903 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRA3P34903 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRA3P34903 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRA3P34903 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRA3P34903 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRA3P34903 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRA3P34903 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRA3P34903 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRA3P34903 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRA3P34903 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRA3P34903 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRA3P34903 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRA3P34903 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRA3P34903 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRA3P34903 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRA3P34903 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRA3P34903 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRA3P34903 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRA3P34903 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRA3P34903 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRA3P34903 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRA3P34903 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRA3P34903 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRA3P34903 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRA3P34903 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRA3P34903 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRA3P34903 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRA3P34903 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRA3P34903 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRA3P34903 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRA3P34903 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRA3P34903 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRA3P34903 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRA3P34903 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRA3P34903 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRA3P34903 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRA3P34903 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRA3P34903 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRA3P34903 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRA3P34903 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRA3P34903 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRA3P34903 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRA3P34903 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRA3P34903 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRA3P34903 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRA3P34903 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRA3P34903 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms