Protein–RNA interactions for Protein: P34903

GABRA3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA3P34903 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GABRA3P34903 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GABRA3P34903 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
GABRA3P34903 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GABRA3P34903 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GABRA3P34903 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GABRA3P34903 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GABRA3P34903 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GABRA3P34903 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GABRA3P34903 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GABRA3P34903 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GABRA3P34903 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GABRA3P34903 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GABRA3P34903 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GABRA3P34903 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GABRA3P34903 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GABRA3P34903 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GABRA3P34903 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GABRA3P34903 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GABRA3P34903 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GABRA3P34903 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GABRA3P34903 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GABRA3P34903 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GABRA3P34903 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GABRA3P34903 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GABRA3P34903 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GABRA3P34903 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GABRA3P34903 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GABRA3P34903 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GABRA3P34903 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GABRA3P34903 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GABRA3P34903 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GABRA3P34903 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GABRA3P34903 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GABRA3P34903 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GABRA3P34903 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GABRA3P34903 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GABRA3P34903 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GABRA3P34903 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GABRA3P34903 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GABRA3P34903 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GABRA3P34903 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GABRA3P34903 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GABRA3P34903 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GABRA3P34903 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GABRA3P34903 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GABRA3P34903 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GABRA3P34903 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABRA3P34903 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GABRA3P34903 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GABRA3P34903 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GABRA3P34903 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GABRA3P34903 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GABRA3P34903 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GABRA3P34903 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GABRA3P34903 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GABRA3P34903 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GABRA3P34903 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GABRA3P34903 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GABRA3P34903 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GABRA3P34903 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABRA3P34903 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABRA3P34903 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GABRA3P34903 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GABRA3P34903 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABRA3P34903 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABRA3P34903 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GABRA3P34903 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GABRA3P34903 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABRA3P34903 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABRA3P34903 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GABRA3P34903 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GABRA3P34903 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GABRA3P34903 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABRA3P34903 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABRA3P34903 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABRA3P34903 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GABRA3P34903 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GABRA3P34903 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GABRA3P34903 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GABRA3P34903 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GABRA3P34903 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABRA3P34903 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABRA3P34903 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABRA3P34903 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABRA3P34903 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GABRA3P34903 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABRA3P34903 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABRA3P34903 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GABRA3P34903 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GABRA3P34903 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GABRA3P34903 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GABRA3P34903 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GABRA3P34903 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABRA3P34903 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABRA3P34903 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GABRA3P34903 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABRA3P34903 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABRA3P34903 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GABRA3P34903 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms