Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MARCKSP29966 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MARCKSP29966 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MARCKSP29966 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MARCKSP29966 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MARCKSP29966 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MARCKSP29966 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
MARCKSP29966 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MARCKSP29966 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MARCKSP29966 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MARCKSP29966 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MARCKSP29966 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MARCKSP29966 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MARCKSP29966 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MARCKSP29966 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MARCKSP29966 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MARCKSP29966 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MARCKSP29966 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MARCKSP29966 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MARCKSP29966 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MARCKSP29966 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MARCKSP29966 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MARCKSP29966 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MARCKSP29966 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MARCKSP29966 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MARCKSP29966 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MARCKSP29966 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MARCKSP29966 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MARCKSP29966 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MARCKSP29966 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MARCKSP29966 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MARCKSP29966 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MARCKSP29966 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MARCKSP29966 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MARCKSP29966 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MARCKSP29966 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MARCKSP29966 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MARCKSP29966 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MARCKSP29966 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MARCKSP29966 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MARCKSP29966 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MARCKSP29966 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MARCKSP29966 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MARCKSP29966 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MARCKSP29966 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MARCKSP29966 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MARCKSP29966 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MARCKSP29966 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MARCKSP29966 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MARCKSP29966 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MARCKSP29966 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MARCKSP29966 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MARCKSP29966 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MARCKSP29966 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MARCKSP29966 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MARCKSP29966 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MARCKSP29966 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MARCKSP29966 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MARCKSP29966 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MARCKSP29966 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MARCKSP29966 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MARCKSP29966 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MARCKSP29966 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MARCKSP29966 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MARCKSP29966 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MARCKSP29966 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MARCKSP29966 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
MARCKSP29966 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MARCKSP29966 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MARCKSP29966 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MARCKSP29966 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MARCKSP29966 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MARCKSP29966 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MARCKSP29966 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MARCKSP29966 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
MARCKSP29966 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MARCKSP29966 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms