Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E2P29084 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2E2P29084 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2E2P29084 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms