Protein–RNA interactions for Protein: P22105

TNXB, Tenascin-X, humanhuman

Predictions only

Length 4,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXBP22105 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXBP22105 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNXBP22105 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXBP22105 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXBP22105 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXBP22105 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXBP22105 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXBP22105 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXBP22105 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXBP22105 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXBP22105 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXBP22105 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXBP22105 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXBP22105 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXBP22105 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXBP22105 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXBP22105 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXBP22105 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXBP22105 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXBP22105 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXBP22105 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXBP22105 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXBP22105 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNXBP22105 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNXBP22105 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNXBP22105 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXBP22105 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXBP22105 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXBP22105 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXBP22105 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXBP22105 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXBP22105 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNXBP22105 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXBP22105 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXBP22105 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNXBP22105 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXBP22105 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXBP22105 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXBP22105 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXBP22105 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXBP22105 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXBP22105 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNXBP22105 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXBP22105 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXBP22105 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXBP22105 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXBP22105 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNXBP22105 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNXBP22105 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNXBP22105 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNXBP22105 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNXBP22105 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNXBP22105 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXBP22105 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXBP22105 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNXBP22105 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNXBP22105 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNXBP22105 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNXBP22105 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNXBP22105 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNXBP22105 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXBP22105 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXBP22105 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXBP22105 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXBP22105 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXBP22105 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNXBP22105 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNXBP22105 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNXBP22105 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNXBP22105 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNXBP22105 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNXBP22105 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNXBP22105 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNXBP22105 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNXBP22105 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNXBP22105 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNXBP22105 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXBP22105 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXBP22105 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXBP22105 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXBP22105 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXBP22105 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXBP22105 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXBP22105 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXBP22105 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXBP22105 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXBP22105 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXBP22105 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXBP22105 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXBP22105 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXBP22105 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXBP22105 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXBP22105 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXBP22105 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXBP22105 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXBP22105 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXBP22105 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXBP22105 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNXBP22105 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNXBP22105 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms