Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD247P20963 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD247P20963 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD247P20963 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CD247P20963 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD247P20963 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD247P20963 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD247P20963 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD247P20963 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CD247P20963 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD247P20963 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD247P20963 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD247P20963 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD247P20963 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD247P20963 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD247P20963 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD247P20963 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CD247P20963 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CD247P20963 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD247P20963 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD247P20963 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD247P20963 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD247P20963 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD247P20963 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD247P20963 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CD247P20963 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD247P20963 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD247P20963 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD247P20963 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CD247P20963 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD247P20963 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD247P20963 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD247P20963 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD247P20963 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD247P20963 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD247P20963 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD247P20963 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD247P20963 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD247P20963 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD247P20963 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD247P20963 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD247P20963 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD247P20963 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD247P20963 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD247P20963 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD247P20963 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD247P20963 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD247P20963 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD247P20963 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD247P20963 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD247P20963 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD247P20963 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD247P20963 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD247P20963 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD247P20963 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD247P20963 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD247P20963 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD247P20963 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD247P20963 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD247P20963 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD247P20963 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD247P20963 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD247P20963 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD247P20963 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD247P20963 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD247P20963 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD247P20963 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CD247P20963 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD247P20963 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD247P20963 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD247P20963 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD247P20963 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD247P20963 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD247P20963 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD247P20963 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CD247P20963 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD247P20963 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD247P20963 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD247P20963 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD247P20963 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD247P20963 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD247P20963 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD247P20963 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD247P20963 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD247P20963 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CD247P20963 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD247P20963 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD247P20963 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CD247P20963 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD247P20963 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD247P20963 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD247P20963 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CD247P20963 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD247P20963 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD247P20963 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD247P20963 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD247P20963 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD247P20963 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD247P20963 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD247P20963 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms