Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
TRHP20396 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
TRHP20396 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC42.04■■■■■ 4.32
TRHP20396 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
TRHP20396 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
TRHP20396 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
TRHP20396 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
TRHP20396 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
TRHP20396 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
TRHP20396 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
TRHP20396 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
TRHP20396 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
TRHP20396 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
TRHP20396 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC42■■■■■ 4.31
TRHP20396 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
TRHP20396 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
TRHP20396 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
TRHP20396 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
TRHP20396 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
TRHP20396 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
TRHP20396 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
TRHP20396 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
TRHP20396 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
TRHP20396 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
TRHP20396 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
TRHP20396 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
TRHP20396 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
TRHP20396 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
TRHP20396 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
TRHP20396 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
TRHP20396 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
TRHP20396 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
TRHP20396 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC41.85■■■■■ 4.29
TRHP20396 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
TRHP20396 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
TRHP20396 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
TRHP20396 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
TRHP20396 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
TRHP20396 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
TRHP20396 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
TRHP20396 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
TRHP20396 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
TRHP20396 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
TRHP20396 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
TRHP20396 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
TRHP20396 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
TRHP20396 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
TRHP20396 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
TRHP20396 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
TRHP20396 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
TRHP20396 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
TRHP20396 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
TRHP20396 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
TRHP20396 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
TRHP20396 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
TRHP20396 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
TRHP20396 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
TRHP20396 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
TRHP20396 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
TRHP20396 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
TRHP20396 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
TRHP20396 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
TRHP20396 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
TRHP20396 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC41.67■■■■■ 4.26
TRHP20396 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
TRHP20396 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
TRHP20396 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
TRHP20396 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
TRHP20396 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
TRHP20396 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
TRHP20396 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
TRHP20396 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
TRHP20396 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
TRHP20396 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
TRHP20396 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
TRHP20396 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
TRHP20396 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
TRHP20396 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
TRHP20396 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
TRHP20396 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
TRHP20396 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
TRHP20396 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
TRHP20396 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
TRHP20396 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
TRHP20396 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
TRHP20396 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
TRHP20396 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
TRHP20396 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
TRHP20396 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
TRHP20396 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
TRHP20396 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
TRHP20396 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
TRHP20396 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
TRHP20396 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
TRHP20396 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
TRHP20396 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
TRHP20396 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
TRHP20396 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
TRHP20396 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
TRHP20396 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms