Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SDSP20132 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SDSP20132 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SDSP20132 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SDSP20132 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SDSP20132 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SDSP20132 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SDSP20132 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
SDSP20132 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SDSP20132 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SDSP20132 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SDSP20132 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SDSP20132 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SDSP20132 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
SDSP20132 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SDSP20132 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SDSP20132 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SDSP20132 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SDSP20132 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
SDSP20132 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SDSP20132 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SDSP20132 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SDSP20132 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SDSP20132 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SDSP20132 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SDSP20132 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SDSP20132 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SDSP20132 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SDSP20132 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SDSP20132 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
SDSP20132 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SDSP20132 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
SDSP20132 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SDSP20132 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SDSP20132 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
SDSP20132 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
SDSP20132 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SDSP20132 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SDSP20132 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SDSP20132 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SDSP20132 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SDSP20132 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SDSP20132 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SDSP20132 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SDSP20132 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SDSP20132 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SDSP20132 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SDSP20132 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SDSP20132 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SDSP20132 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SDSP20132 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SDSP20132 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SDSP20132 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SDSP20132 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SDSP20132 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SDSP20132 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
SDSP20132 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SDSP20132 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SDSP20132 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SDSP20132 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SDSP20132 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SDSP20132 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SDSP20132 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SDSP20132 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
SDSP20132 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SDSP20132 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SDSP20132 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SDSP20132 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SDSP20132 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SDSP20132 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SDSP20132 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SDSP20132 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
SDSP20132 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SDSP20132 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SDSP20132 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SDSP20132 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SDSP20132 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SDSP20132 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SDSP20132 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SDSP20132 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SDSP20132 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SDSP20132 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
SDSP20132 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SDSP20132 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SDSP20132 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SDSP20132 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SDSP20132 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SDSP20132 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SDSP20132 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SDSP20132 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SDSP20132 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SDSP20132 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SDSP20132 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SDSP20132 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SDSP20132 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SDSP20132 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SDSP20132 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SDSP20132 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SDSP20132 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SDSP20132 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms