Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFE3P19532 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFE3P19532 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFE3P19532 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFE3P19532 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFE3P19532 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TFE3P19532 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TFE3P19532 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TFE3P19532 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TFE3P19532 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TFE3P19532 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TFE3P19532 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TFE3P19532 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TFE3P19532 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFE3P19532 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFE3P19532 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFE3P19532 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TFE3P19532 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TFE3P19532 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TFE3P19532 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TFE3P19532 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TFE3P19532 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TFE3P19532 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TFE3P19532 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TFE3P19532 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TFE3P19532 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TFE3P19532 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TFE3P19532 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TFE3P19532 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TFE3P19532 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TFE3P19532 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TFE3P19532 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TFE3P19532 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TFE3P19532 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TFE3P19532 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TFE3P19532 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TFE3P19532 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TFE3P19532 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TFE3P19532 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TFE3P19532 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TFE3P19532 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TFE3P19532 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TFE3P19532 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFE3P19532 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TFE3P19532 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFE3P19532 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TFE3P19532 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TFE3P19532 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TFE3P19532 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TFE3P19532 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TFE3P19532 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TFE3P19532 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TFE3P19532 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TFE3P19532 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TFE3P19532 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TFE3P19532 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TFE3P19532 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TFE3P19532 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TFE3P19532 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TFE3P19532 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TFE3P19532 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TFE3P19532 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TFE3P19532 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TFE3P19532 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TFE3P19532 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TFE3P19532 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFE3P19532 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TFE3P19532 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFE3P19532 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFE3P19532 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFE3P19532 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFE3P19532 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TFE3P19532 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TFE3P19532 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TFE3P19532 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TFE3P19532 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TFE3P19532 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TFE3P19532 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TFE3P19532 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TFE3P19532 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TFE3P19532 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TFE3P19532 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TFE3P19532 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFE3P19532 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFE3P19532 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TFE3P19532 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TFE3P19532 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFE3P19532 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFE3P19532 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFE3P19532 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TFE3P19532 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TFE3P19532 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TFE3P19532 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TFE3P19532 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TFE3P19532 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TFE3P19532 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TFE3P19532 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TFE3P19532 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TFE3P19532 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TFE3P19532 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms