Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN1P18031 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN1P18031 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN1P18031 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN1P18031 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN1P18031 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN1P18031 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN1P18031 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN1P18031 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN1P18031 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN1P18031 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN1P18031 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN1P18031 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN1P18031 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN1P18031 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN1P18031 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN1P18031 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN1P18031 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN1P18031 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPN1P18031 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPN1P18031 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPN1P18031 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PTPN1P18031 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN1P18031 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN1P18031 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN1P18031 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN1P18031 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN1P18031 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN1P18031 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN1P18031 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN1P18031 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN1P18031 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN1P18031 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN1P18031 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN1P18031 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN1P18031 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PTPN1P18031 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN1P18031 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN1P18031 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN1P18031 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN1P18031 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN1P18031 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN1P18031 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN1P18031 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN1P18031 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN1P18031 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN1P18031 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN1P18031 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN1P18031 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN1P18031 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN1P18031 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN1P18031 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN1P18031 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN1P18031 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN1P18031 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN1P18031 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN1P18031 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPN1P18031 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN1P18031 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN1P18031 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms