Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB4P17483 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB4P17483 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB4P17483 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB4P17483 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB4P17483 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB4P17483 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB4P17483 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB4P17483 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB4P17483 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB4P17483 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB4P17483 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB4P17483 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB4P17483 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB4P17483 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB4P17483 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB4P17483 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB4P17483 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB4P17483 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB4P17483 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB4P17483 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB4P17483 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB4P17483 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB4P17483 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB4P17483 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB4P17483 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB4P17483 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB4P17483 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB4P17483 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB4P17483 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB4P17483 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB4P17483 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB4P17483 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB4P17483 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB4P17483 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB4P17483 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB4P17483 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB4P17483 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB4P17483 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB4P17483 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB4P17483 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB4P17483 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB4P17483 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXB4P17483 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXB4P17483 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB4P17483 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB4P17483 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB4P17483 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB4P17483 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB4P17483 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB4P17483 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB4P17483 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB4P17483 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB4P17483 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB4P17483 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB4P17483 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB4P17483 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB4P17483 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB4P17483 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB4P17483 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB4P17483 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB4P17483 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB4P17483 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB4P17483 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB4P17483 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB4P17483 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB4P17483 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB4P17483 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXB4P17483 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms