Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXB8P17481 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXB8P17481 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXB8P17481 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXB8P17481 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXB8P17481 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXB8P17481 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXB8P17481 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXB8P17481 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXB8P17481 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXB8P17481 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXB8P17481 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXB8P17481 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXB8P17481 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXB8P17481 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXB8P17481 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXB8P17481 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXB8P17481 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXB8P17481 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXB8P17481 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXB8P17481 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXB8P17481 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
HOXB8P17481 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HOXB8P17481 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXB8P17481 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXB8P17481 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXB8P17481 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXB8P17481 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOXB8P17481 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXB8P17481 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXB8P17481 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXB8P17481 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
HOXB8P17481 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXB8P17481 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXB8P17481 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXB8P17481 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXB8P17481 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXB8P17481 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXB8P17481 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXB8P17481 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXB8P17481 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXB8P17481 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXB8P17481 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXB8P17481 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXB8P17481 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXB8P17481 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXB8P17481 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXB8P17481 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXB8P17481 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXB8P17481 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXB8P17481 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXB8P17481 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXB8P17481 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXB8P17481 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXB8P17481 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXB8P17481 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXB8P17481 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXB8P17481 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXB8P17481 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXB8P17481 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HOXB8P17481 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXB8P17481 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXB8P17481 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXB8P17481 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXB8P17481 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXB8P17481 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXB8P17481 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXB8P17481 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXB8P17481 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXB8P17481 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXB8P17481 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXB8P17481 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXB8P17481 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXB8P17481 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXB8P17481 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXB8P17481 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXB8P17481 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXB8P17481 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB8P17481 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB8P17481 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB8P17481 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB8P17481 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXB8P17481 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXB8P17481 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXB8P17481 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXB8P17481 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXB8P17481 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXB8P17481 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 273.9 ms