Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACADSP16219 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACADSP16219 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACADSP16219 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACADSP16219 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACADSP16219 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACADSP16219 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACADSP16219 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACADSP16219 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACADSP16219 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACADSP16219 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACADSP16219 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACADSP16219 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACADSP16219 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACADSP16219 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACADSP16219 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACADSP16219 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACADSP16219 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACADSP16219 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACADSP16219 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACADSP16219 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACADSP16219 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACADSP16219 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACADSP16219 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACADSP16219 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACADSP16219 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACADSP16219 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACADSP16219 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACADSP16219 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACADSP16219 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACADSP16219 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACADSP16219 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACADSP16219 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACADSP16219 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACADSP16219 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACADSP16219 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACADSP16219 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACADSP16219 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACADSP16219 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACADSP16219 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACADSP16219 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACADSP16219 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACADSP16219 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACADSP16219 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACADSP16219 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACADSP16219 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACADSP16219 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACADSP16219 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACADSP16219 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACADSP16219 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACADSP16219 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACADSP16219 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACADSP16219 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACADSP16219 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADSP16219 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADSP16219 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADSP16219 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADSP16219 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADSP16219 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADSP16219 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACADSP16219 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACADSP16219 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACADSP16219 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACADSP16219 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACADSP16219 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACADSP16219 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACADSP16219 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACADSP16219 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACADSP16219 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACADSP16219 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACADSP16219 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACADSP16219 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACADSP16219 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACADSP16219 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACADSP16219 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACADSP16219 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACADSP16219 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACADSP16219 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACADSP16219 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACADSP16219 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ACADSP16219 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACADSP16219 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACADSP16219 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACADSP16219 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACADSP16219 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACADSP16219 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACADSP16219 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACADSP16219 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACADSP16219 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACADSP16219 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACADSP16219 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACADSP16219 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACADSP16219 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACADSP16219 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACADSP16219 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACADSP16219 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ACADSP16219 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACADSP16219 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACADSP16219 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACADSP16219 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms