Protein–RNA interactions for Protein: P15622

ZNF250, Zinc finger protein 250, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF250P15622 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF250P15622 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF250P15622 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF250P15622 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF250P15622 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF250P15622 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF250P15622 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF250P15622 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF250P15622 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF250P15622 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF250P15622 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF250P15622 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF250P15622 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF250P15622 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF250P15622 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF250P15622 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF250P15622 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF250P15622 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF250P15622 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF250P15622 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF250P15622 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF250P15622 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF250P15622 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF250P15622 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF250P15622 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF250P15622 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF250P15622 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF250P15622 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF250P15622 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF250P15622 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF250P15622 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF250P15622 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF250P15622 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF250P15622 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF250P15622 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF250P15622 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF250P15622 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF250P15622 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF250P15622 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF250P15622 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF250P15622 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF250P15622 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF250P15622 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF250P15622 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF250P15622 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF250P15622 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF250P15622 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF250P15622 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF250P15622 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms