Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DMDP11532 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DMDP11532 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DMDP11532 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DMDP11532 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DMDP11532 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DMDP11532 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DMDP11532 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DMDP11532 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DMDP11532 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
DMDP11532 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DMDP11532 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DMDP11532 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DMDP11532 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DMDP11532 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DMDP11532 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DMDP11532 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DMDP11532 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DMDP11532 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DMDP11532 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DMDP11532 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DMDP11532 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DMDP11532 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DMDP11532 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DMDP11532 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DMDP11532 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DMDP11532 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DMDP11532 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DMDP11532 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DMDP11532 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DMDP11532 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DMDP11532 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DMDP11532 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DMDP11532 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DMDP11532 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DMDP11532 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DMDP11532 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DMDP11532 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DMDP11532 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DMDP11532 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DMDP11532 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DMDP11532 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DMDP11532 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DMDP11532 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DMDP11532 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DMDP11532 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DMDP11532 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DMDP11532 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
DMDP11532 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DMDP11532 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
DMDP11532 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DMDP11532 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DMDP11532 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DMDP11532 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DMDP11532 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DMDP11532 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DMDP11532 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DMDP11532 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DMDP11532 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DMDP11532 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DMDP11532 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DMDP11532 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DMDP11532 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DMDP11532 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DMDP11532 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DMDP11532 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DMDP11532 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DMDP11532 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DMDP11532 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DMDP11532 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DMDP11532 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DMDP11532 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
DMDP11532 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DMDP11532 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DMDP11532 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DMDP11532 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DMDP11532 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DMDP11532 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DMDP11532 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DMDP11532 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DMDP11532 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DMDP11532 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DMDP11532 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DMDP11532 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DMDP11532 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DMDP11532 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DMDP11532 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DMDP11532 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DMDP11532 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DMDP11532 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DMDP11532 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DMDP11532 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DMDP11532 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DMDP11532 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DMDP11532 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DMDP11532 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DMDP11532 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DMDP11532 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DMDP11532 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DMDP11532 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms