Protein–RNA interactions for Protein: P11362

FGFR1, Fibroblast growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR1P11362 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGFR1P11362 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGFR1P11362 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGFR1P11362 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FGFR1P11362 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGFR1P11362 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGFR1P11362 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGFR1P11362 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FGFR1P11362 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGFR1P11362 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGFR1P11362 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGFR1P11362 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGFR1P11362 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGFR1P11362 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGFR1P11362 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGFR1P11362 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGFR1P11362 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGFR1P11362 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGFR1P11362 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGFR1P11362 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGFR1P11362 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGFR1P11362 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGFR1P11362 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGFR1P11362 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGFR1P11362 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGFR1P11362 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FGFR1P11362 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FGFR1P11362 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FGFR1P11362 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGFR1P11362 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FGFR1P11362 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGFR1P11362 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGFR1P11362 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGFR1P11362 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGFR1P11362 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGFR1P11362 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FGFR1P11362 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FGFR1P11362 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGFR1P11362 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGFR1P11362 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGFR1P11362 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGFR1P11362 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGFR1P11362 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGFR1P11362 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGFR1P11362 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGFR1P11362 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGFR1P11362 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGFR1P11362 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGFR1P11362 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGFR1P11362 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGFR1P11362 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
FGFR1P11362 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGFR1P11362 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGFR1P11362 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGFR1P11362 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGFR1P11362 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGFR1P11362 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGFR1P11362 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGFR1P11362 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGFR1P11362 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGFR1P11362 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGFR1P11362 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGFR1P11362 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGFR1P11362 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGFR1P11362 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGFR1P11362 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGFR1P11362 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGFR1P11362 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGFR1P11362 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGFR1P11362 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGFR1P11362 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGFR1P11362 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGFR1P11362 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGFR1P11362 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGFR1P11362 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGFR1P11362 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGFR1P11362 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGFR1P11362 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGFR1P11362 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGFR1P11362 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGFR1P11362 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGFR1P11362 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGFR1P11362 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGFR1P11362 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGFR1P11362 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGFR1P11362 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGFR1P11362 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGFR1P11362 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGFR1P11362 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGFR1P11362 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGFR1P11362 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGFR1P11362 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGFR1P11362 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGFR1P11362 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGFR1P11362 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGFR1P11362 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGFR1P11362 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGFR1P11362 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGFR1P11362 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGFR1P11362 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms