Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI4P10075 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI4P10075 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI4P10075 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI4P10075 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI4P10075 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI4P10075 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI4P10075 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI4P10075 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI4P10075 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI4P10075 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI4P10075 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI4P10075 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI4P10075 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI4P10075 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI4P10075 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI4P10075 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI4P10075 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI4P10075 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI4P10075 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI4P10075 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI4P10075 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI4P10075 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI4P10075 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI4P10075 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI4P10075 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI4P10075 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI4P10075 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI4P10075 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI4P10075 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI4P10075 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI4P10075 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI4P10075 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI4P10075 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI4P10075 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI4P10075 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI4P10075 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI4P10075 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI4P10075 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI4P10075 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI4P10075 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI4P10075 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI4P10075 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI4P10075 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI4P10075 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI4P10075 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI4P10075 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI4P10075 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI4P10075 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI4P10075 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI4P10075 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI4P10075 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI4P10075 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI4P10075 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI4P10075 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI4P10075 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI4P10075 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI4P10075 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI4P10075 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI4P10075 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI4P10075 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLI4P10075 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI4P10075 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI4P10075 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLI4P10075 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI4P10075 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI4P10075 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI4P10075 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI4P10075 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLI4P10075 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI4P10075 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI4P10075 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLI4P10075 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI4P10075 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI4P10075 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI4P10075 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI4P10075 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI4P10075 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI4P10075 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI4P10075 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI4P10075 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI4P10075 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI4P10075 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI4P10075 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI4P10075 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI4P10075 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI4P10075 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI4P10075 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI4P10075 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI4P10075 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GLI4P10075 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GLI4P10075 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI4P10075 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI4P10075 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI4P10075 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI4P10075 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI4P10075 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI4P10075 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI4P10075 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI4P10075 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms