Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CENPBP07199 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CENPBP07199 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CENPBP07199 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CENPBP07199 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CENPBP07199 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CENPBP07199 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CENPBP07199 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CENPBP07199 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
CENPBP07199 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CENPBP07199 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CENPBP07199 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CENPBP07199 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CENPBP07199 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CENPBP07199 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CENPBP07199 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CENPBP07199 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CENPBP07199 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CENPBP07199 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CENPBP07199 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CENPBP07199 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CENPBP07199 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CENPBP07199 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CENPBP07199 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CENPBP07199 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CENPBP07199 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CENPBP07199 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CENPBP07199 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CENPBP07199 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CENPBP07199 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CENPBP07199 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CENPBP07199 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CENPBP07199 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CENPBP07199 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CENPBP07199 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CENPBP07199 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CENPBP07199 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CENPBP07199 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
CENPBP07199 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CENPBP07199 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CENPBP07199 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CENPBP07199 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CENPBP07199 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CENPBP07199 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CENPBP07199 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CENPBP07199 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CENPBP07199 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CENPBP07199 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CENPBP07199 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CENPBP07199 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CENPBP07199 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CENPBP07199 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CENPBP07199 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CENPBP07199 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CENPBP07199 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CENPBP07199 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CENPBP07199 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CENPBP07199 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CENPBP07199 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CENPBP07199 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CENPBP07199 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CENPBP07199 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CENPBP07199 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CENPBP07199 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CENPBP07199 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CENPBP07199 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CENPBP07199 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CENPBP07199 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CENPBP07199 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CENPBP07199 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CENPBP07199 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CENPBP07199 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CENPBP07199 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CENPBP07199 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CENPBP07199 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CENPBP07199 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CENPBP07199 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CENPBP07199 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CENPBP07199 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CENPBP07199 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CENPBP07199 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CENPBP07199 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CENPBP07199 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CENPBP07199 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CENPBP07199 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CENPBP07199 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CENPBP07199 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CENPBP07199 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CENPBP07199 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CENPBP07199 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CENPBP07199 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CENPBP07199 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CENPBP07199 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CENPBP07199 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CENPBP07199 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CENPBP07199 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CENPBP07199 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CENPBP07199 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CENPBP07199 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CENPBP07199 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms