Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-AP01891 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-AP01891 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-AP01891 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-AP01891 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-AP01891 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-AP01891 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-AP01891 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-AP01891 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-AP01891 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-AP01891 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-AP01891 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-AP01891 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-AP01891 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-AP01891 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-AP01891 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-AP01891 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-AP01891 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-AP01891 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-AP01891 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-AP01891 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-AP01891 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HLA-AP01891 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-AP01891 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-AP01891 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-AP01891 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-AP01891 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-AP01891 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-AP01891 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-AP01891 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-AP01891 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-AP01891 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-AP01891 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-AP01891 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-AP01891 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-AP01891 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-AP01891 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-AP01891 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-AP01891 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-AP01891 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-AP01891 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-AP01891 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-AP01891 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-AP01891 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-AP01891 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HLA-AP01891 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-AP01891 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-AP01891 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms