Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA4FO95754 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA4FO95754 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA4FO95754 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA4FO95754 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA4FO95754 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA4FO95754 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA4FO95754 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA4FO95754 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA4FO95754 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA4FO95754 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA4FO95754 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA4FO95754 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA4FO95754 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA4FO95754 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA4FO95754 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA4FO95754 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA4FO95754 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA4FO95754 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA4FO95754 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA4FO95754 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA4FO95754 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA4FO95754 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA4FO95754 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA4FO95754 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA4FO95754 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA4FO95754 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA4FO95754 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA4FO95754 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA4FO95754 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA4FO95754 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA4FO95754 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA4FO95754 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA4FO95754 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA4FO95754 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA4FO95754 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA4FO95754 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA4FO95754 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA4FO95754 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA4FO95754 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA4FO95754 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA4FO95754 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA4FO95754 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA4FO95754 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA4FO95754 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA4FO95754 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA4FO95754 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA4FO95754 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA4FO95754 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA4FO95754 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA4FO95754 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA4FO95754 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA4FO95754 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA4FO95754 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA4FO95754 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA4FO95754 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA4FO95754 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA4FO95754 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA4FO95754 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA4FO95754 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA4FO95754 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA4FO95754 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA4FO95754 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA4FO95754 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA4FO95754 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4FO95754 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4FO95754 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4FO95754 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA4FO95754 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA4FO95754 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA4FO95754 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA4FO95754 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SEMA4FO95754 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SEMA4FO95754 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA4FO95754 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA4FO95754 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA4FO95754 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA4FO95754 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA4FO95754 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA4FO95754 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA4FO95754 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA4FO95754 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA4FO95754 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4FO95754 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4FO95754 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4FO95754 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4FO95754 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4FO95754 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA4FO95754 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA4FO95754 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA4FO95754 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA4FO95754 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA4FO95754 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA4FO95754 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA4FO95754 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms