Protein–RNA interactions for Protein: O95231

VENTX, Homeobox protein VENTX, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VENTXO95231 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VENTXO95231 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VENTXO95231 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VENTXO95231 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VENTXO95231 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VENTXO95231 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VENTXO95231 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VENTXO95231 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VENTXO95231 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VENTXO95231 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VENTXO95231 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VENTXO95231 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VENTXO95231 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VENTXO95231 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VENTXO95231 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VENTXO95231 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VENTXO95231 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VENTXO95231 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VENTXO95231 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VENTXO95231 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VENTXO95231 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VENTXO95231 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VENTXO95231 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VENTXO95231 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VENTXO95231 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VENTXO95231 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VENTXO95231 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VENTXO95231 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VENTXO95231 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VENTXO95231 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VENTXO95231 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VENTXO95231 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VENTXO95231 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VENTXO95231 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VENTXO95231 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VENTXO95231 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VENTXO95231 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VENTXO95231 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VENTXO95231 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VENTXO95231 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VENTXO95231 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VENTXO95231 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VENTXO95231 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VENTXO95231 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VENTXO95231 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VENTXO95231 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VENTXO95231 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VENTXO95231 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VENTXO95231 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VENTXO95231 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VENTXO95231 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VENTXO95231 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VENTXO95231 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VENTXO95231 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VENTXO95231 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VENTXO95231 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VENTXO95231 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VENTXO95231 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VENTXO95231 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VENTXO95231 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VENTXO95231 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VENTXO95231 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VENTXO95231 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VENTXO95231 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VENTXO95231 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VENTXO95231 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VENTXO95231 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VENTXO95231 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VENTXO95231 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VENTXO95231 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VENTXO95231 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VENTXO95231 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VENTXO95231 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VENTXO95231 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VENTXO95231 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VENTXO95231 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VENTXO95231 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VENTXO95231 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VENTXO95231 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VENTXO95231 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VENTXO95231 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VENTXO95231 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VENTXO95231 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VENTXO95231 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VENTXO95231 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VENTXO95231 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VENTXO95231 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VENTXO95231 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VENTXO95231 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VENTXO95231 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VENTXO95231 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VENTXO95231 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VENTXO95231 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VENTXO95231 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VENTXO95231 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VENTXO95231 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VENTXO95231 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VENTXO95231 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VENTXO95231 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VENTXO95231 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.2 ms