Protein–RNA interactions for Protein: O95164

UBL3, Ubiquitin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL3O95164 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBL3O95164 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBL3O95164 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBL3O95164 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBL3O95164 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBL3O95164 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBL3O95164 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBL3O95164 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBL3O95164 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBL3O95164 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBL3O95164 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBL3O95164 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBL3O95164 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
UBL3O95164 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBL3O95164 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBL3O95164 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBL3O95164 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBL3O95164 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBL3O95164 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBL3O95164 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBL3O95164 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBL3O95164 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBL3O95164 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBL3O95164 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBL3O95164 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBL3O95164 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBL3O95164 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBL3O95164 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBL3O95164 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBL3O95164 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBL3O95164 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBL3O95164 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBL3O95164 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBL3O95164 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBL3O95164 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBL3O95164 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBL3O95164 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBL3O95164 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBL3O95164 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBL3O95164 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBL3O95164 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBL3O95164 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBL3O95164 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBL3O95164 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBL3O95164 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBL3O95164 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBL3O95164 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBL3O95164 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBL3O95164 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBL3O95164 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBL3O95164 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBL3O95164 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBL3O95164 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBL3O95164 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBL3O95164 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBL3O95164 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBL3O95164 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBL3O95164 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBL3O95164 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBL3O95164 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBL3O95164 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBL3O95164 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBL3O95164 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBL3O95164 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBL3O95164 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBL3O95164 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBL3O95164 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBL3O95164 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBL3O95164 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBL3O95164 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBL3O95164 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBL3O95164 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBL3O95164 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBL3O95164 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBL3O95164 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBL3O95164 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBL3O95164 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBL3O95164 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBL3O95164 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBL3O95164 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBL3O95164 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBL3O95164 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBL3O95164 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBL3O95164 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBL3O95164 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBL3O95164 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBL3O95164 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBL3O95164 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBL3O95164 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBL3O95164 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBL3O95164 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBL3O95164 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBL3O95164 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBL3O95164 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBL3O95164 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBL3O95164 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBL3O95164 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBL3O95164 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBL3O95164 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBL3O95164 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms