Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP3O75386 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP3O75386 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP3O75386 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP3O75386 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP3O75386 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP3O75386 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP3O75386 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP3O75386 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP3O75386 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP3O75386 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP3O75386 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP3O75386 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP3O75386 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TULP3O75386 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TULP3O75386 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TULP3O75386 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP3O75386 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP3O75386 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP3O75386 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP3O75386 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP3O75386 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP3O75386 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP3O75386 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP3O75386 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP3O75386 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP3O75386 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TULP3O75386 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TULP3O75386 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TULP3O75386 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TULP3O75386 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TULP3O75386 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TULP3O75386 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TULP3O75386 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TULP3O75386 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TULP3O75386 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP3O75386 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP3O75386 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP3O75386 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP3O75386 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP3O75386 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP3O75386 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP3O75386 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP3O75386 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP3O75386 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP3O75386 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP3O75386 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP3O75386 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP3O75386 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP3O75386 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP3O75386 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TULP3O75386 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TULP3O75386 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TULP3O75386 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TULP3O75386 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TULP3O75386 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TULP3O75386 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TULP3O75386 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TULP3O75386 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TULP3O75386 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TULP3O75386 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TULP3O75386 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TULP3O75386 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TULP3O75386 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP3O75386 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP3O75386 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP3O75386 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP3O75386 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP3O75386 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TULP3O75386 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TULP3O75386 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP3O75386 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP3O75386 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP3O75386 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP3O75386 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP3O75386 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP3O75386 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP3O75386 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP3O75386 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP3O75386 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TULP3O75386 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TULP3O75386 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TULP3O75386 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TULP3O75386 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TULP3O75386 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TULP3O75386 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TULP3O75386 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP3O75386 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP3O75386 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP3O75386 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TULP3O75386 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TULP3O75386 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP3O75386 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP3O75386 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP3O75386 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP3O75386 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP3O75386 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP3O75386 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP3O75386 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP3O75386 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms