Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
N4BP1O75113 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
N4BP1O75113 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
N4BP1O75113 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
N4BP1O75113 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
N4BP1O75113 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
N4BP1O75113 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
N4BP1O75113 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
N4BP1O75113 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
N4BP1O75113 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
N4BP1O75113 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
N4BP1O75113 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
N4BP1O75113 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
N4BP1O75113 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
N4BP1O75113 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
N4BP1O75113 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
N4BP1O75113 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
N4BP1O75113 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
N4BP1O75113 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
N4BP1O75113 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
N4BP1O75113 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
N4BP1O75113 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
N4BP1O75113 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
N4BP1O75113 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
N4BP1O75113 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
N4BP1O75113 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
N4BP1O75113 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
N4BP1O75113 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
N4BP1O75113 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
N4BP1O75113 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
N4BP1O75113 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
N4BP1O75113 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
N4BP1O75113 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
N4BP1O75113 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
N4BP1O75113 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
N4BP1O75113 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
N4BP1O75113 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
N4BP1O75113 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
N4BP1O75113 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
N4BP1O75113 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
N4BP1O75113 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
N4BP1O75113 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
N4BP1O75113 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
N4BP1O75113 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
N4BP1O75113 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
N4BP1O75113 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
N4BP1O75113 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
N4BP1O75113 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
N4BP1O75113 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
N4BP1O75113 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
N4BP1O75113 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
N4BP1O75113 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
N4BP1O75113 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
N4BP1O75113 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
N4BP1O75113 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
N4BP1O75113 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
N4BP1O75113 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
N4BP1O75113 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
N4BP1O75113 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
N4BP1O75113 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
N4BP1O75113 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
N4BP1O75113 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
N4BP1O75113 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
N4BP1O75113 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
N4BP1O75113 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
N4BP1O75113 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
N4BP1O75113 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
N4BP1O75113 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
N4BP1O75113 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
N4BP1O75113 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
N4BP1O75113 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
N4BP1O75113 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
N4BP1O75113 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
N4BP1O75113 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
N4BP1O75113 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
N4BP1O75113 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
N4BP1O75113 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms