Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD2O60548 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD2O60548 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD2O60548 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD2O60548 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD2O60548 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD2O60548 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD2O60548 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD2O60548 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD2O60548 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD2O60548 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD2O60548 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD2O60548 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD2O60548 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD2O60548 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD2O60548 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD2O60548 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD2O60548 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD2O60548 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD2O60548 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD2O60548 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXD2O60548 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXD2O60548 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD2O60548 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD2O60548 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD2O60548 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD2O60548 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD2O60548 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD2O60548 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD2O60548 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD2O60548 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD2O60548 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD2O60548 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD2O60548 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD2O60548 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD2O60548 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD2O60548 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD2O60548 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD2O60548 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD2O60548 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD2O60548 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD2O60548 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD2O60548 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD2O60548 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD2O60548 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD2O60548 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD2O60548 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD2O60548 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD2O60548 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD2O60548 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD2O60548 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD2O60548 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD2O60548 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD2O60548 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD2O60548 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD2O60548 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD2O60548 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD2O60548 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD2O60548 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD2O60548 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD2O60548 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD2O60548 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD2O60548 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD2O60548 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD2O60548 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD2O60548 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD2O60548 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD2O60548 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD2O60548 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD2O60548 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD2O60548 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD2O60548 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD2O60548 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD2O60548 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD2O60548 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD2O60548 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD2O60548 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXD2O60548 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FOXD2O60548 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD2O60548 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD2O60548 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD2O60548 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD2O60548 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD2O60548 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD2O60548 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD2O60548 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD2O60548 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD2O60548 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD2O60548 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD2O60548 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD2O60548 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD2O60548 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD2O60548 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD2O60548 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD2O60548 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD2O60548 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD2O60548 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD2O60548 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXD2O60548 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXD2O60548 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms