Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUBNO60494 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUBNO60494 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUBNO60494 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUBNO60494 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUBNO60494 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUBNO60494 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUBNO60494 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUBNO60494 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUBNO60494 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUBNO60494 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUBNO60494 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUBNO60494 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUBNO60494 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUBNO60494 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUBNO60494 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUBNO60494 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUBNO60494 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUBNO60494 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUBNO60494 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUBNO60494 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUBNO60494 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUBNO60494 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUBNO60494 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUBNO60494 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUBNO60494 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CUBNO60494 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CUBNO60494 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUBNO60494 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUBNO60494 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUBNO60494 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CUBNO60494 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CUBNO60494 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUBNO60494 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUBNO60494 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUBNO60494 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUBNO60494 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUBNO60494 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUBNO60494 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CUBNO60494 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CUBNO60494 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUBNO60494 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CUBNO60494 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CUBNO60494 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUBNO60494 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUBNO60494 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUBNO60494 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUBNO60494 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUBNO60494 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUBNO60494 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUBNO60494 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUBNO60494 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUBNO60494 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUBNO60494 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUBNO60494 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUBNO60494 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CUBNO60494 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUBNO60494 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUBNO60494 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUBNO60494 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUBNO60494 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUBNO60494 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUBNO60494 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUBNO60494 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUBNO60494 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUBNO60494 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUBNO60494 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUBNO60494 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUBNO60494 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUBNO60494 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUBNO60494 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CUBNO60494 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUBNO60494 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUBNO60494 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CUBNO60494 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CUBNO60494 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CUBNO60494 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUBNO60494 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUBNO60494 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUBNO60494 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUBNO60494 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CUBNO60494 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUBNO60494 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUBNO60494 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CUBNO60494 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUBNO60494 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUBNO60494 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUBNO60494 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUBNO60494 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CUBNO60494 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUBNO60494 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUBNO60494 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUBNO60494 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CUBNO60494 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUBNO60494 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUBNO60494 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUBNO60494 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUBNO60494 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUBNO60494 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUBNO60494 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms