Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC25A20O43772 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC25A20O43772 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A20O43772 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms