Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
FANCAO15360 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.38■■■■■ 4.05
FANCAO15360 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
FANCAO15360 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
FANCAO15360 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
FANCAO15360 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
FANCAO15360 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
FANCAO15360 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
FANCAO15360 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
FANCAO15360 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
FANCAO15360 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
FANCAO15360 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
FANCAO15360 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
FANCAO15360 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
FANCAO15360 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
FANCAO15360 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
FANCAO15360 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
FANCAO15360 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
FANCAO15360 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
FANCAO15360 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
FANCAO15360 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
FANCAO15360 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
FANCAO15360 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
FANCAO15360 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
FANCAO15360 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
FANCAO15360 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
FANCAO15360 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
FANCAO15360 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
FANCAO15360 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
FANCAO15360 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
FANCAO15360 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
FANCAO15360 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
FANCAO15360 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
FANCAO15360 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
FANCAO15360 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
FANCAO15360 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.03
FANCAO15360 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.03
FANCAO15360 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
FANCAO15360 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
FANCAO15360 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
FANCAO15360 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
FANCAO15360 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
FANCAO15360 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
FANCAO15360 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
FANCAO15360 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
FANCAO15360 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
FANCAO15360 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
FANCAO15360 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
FANCAO15360 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
FANCAO15360 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC40.13■■■■■ 4.01
FANCAO15360 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
FANCAO15360 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
FANCAO15360 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
FANCAO15360 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
FANCAO15360 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
FANCAO15360 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
FANCAO15360 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
FANCAO15360 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
FANCAO15360 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
FANCAO15360 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
FANCAO15360 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4.01
FANCAO15360 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
FANCAO15360 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
FANCAO15360 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
FANCAO15360 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
FANCAO15360 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
FANCAO15360 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
FANCAO15360 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
FANCAO15360 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC40.05■■■■■ 4
FANCAO15360 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
FANCAO15360 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC40.04■■■■■ 4
FANCAO15360 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
FANCAO15360 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
FANCAO15360 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
FANCAO15360 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
FANCAO15360 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
FANCAO15360 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
FANCAO15360 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
FANCAO15360 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
FANCAO15360 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
FANCAO15360 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
FANCAO15360 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
FANCAO15360 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
FANCAO15360 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
FANCAO15360 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
FANCAO15360 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
FANCAO15360 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
FANCAO15360 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
FANCAO15360 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
FANCAO15360 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
FANCAO15360 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
FANCAO15360 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
FANCAO15360 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
FANCAO15360 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
FANCAO15360 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
FANCAO15360 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
FANCAO15360 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
FANCAO15360 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
FANCAO15360 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
FANCAO15360 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms