Protein–RNA interactions for Protein: O15105

SMAD7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD7O15105 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMAD7O15105 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD7O15105 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD7O15105 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD7O15105 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD7O15105 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD7O15105 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD7O15105 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD7O15105 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD7O15105 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD7O15105 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD7O15105 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD7O15105 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD7O15105 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD7O15105 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD7O15105 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD7O15105 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD7O15105 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD7O15105 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD7O15105 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD7O15105 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD7O15105 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD7O15105 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD7O15105 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD7O15105 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD7O15105 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD7O15105 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD7O15105 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD7O15105 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD7O15105 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD7O15105 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD7O15105 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD7O15105 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD7O15105 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD7O15105 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD7O15105 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD7O15105 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD7O15105 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD7O15105 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD7O15105 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD7O15105 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD7O15105 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD7O15105 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD7O15105 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD7O15105 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD7O15105 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD7O15105 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD7O15105 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD7O15105 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD7O15105 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD7O15105 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms