Protein–RNA interactions for Protein: C9JN71

ZNF878, Zinc finger protein 878, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF878C9JN71 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF878C9JN71 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF878C9JN71 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF878C9JN71 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF878C9JN71 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF878C9JN71 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF878C9JN71 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF878C9JN71 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF878C9JN71 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF878C9JN71 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF878C9JN71 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF878C9JN71 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF878C9JN71 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF878C9JN71 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF878C9JN71 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF878C9JN71 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF878C9JN71 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF878C9JN71 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF878C9JN71 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF878C9JN71 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF878C9JN71 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF878C9JN71 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF878C9JN71 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF878C9JN71 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF878C9JN71 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms