Protein–RNA interactions for Protein: A6NJZ7

RIMBP3C, RIMS-binding protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3CA6NJZ7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
RIMBP3CA6NJZ7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
RIMBP3CA6NJZ7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
RIMBP3CA6NJZ7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
RIMBP3CA6NJZ7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
RIMBP3CA6NJZ7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
RIMBP3CA6NJZ7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
RIMBP3CA6NJZ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
RIMBP3CA6NJZ7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC43.18■■■■■ 4.5
RIMBP3CA6NJZ7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
RIMBP3CA6NJZ7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
RIMBP3CA6NJZ7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
RIMBP3CA6NJZ7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
RIMBP3CA6NJZ7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
RIMBP3CA6NJZ7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
RIMBP3CA6NJZ7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
RIMBP3CA6NJZ7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
RIMBP3CA6NJZ7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
RIMBP3CA6NJZ7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
RIMBP3CA6NJZ7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC43.09■■■■■ 4.49
RIMBP3CA6NJZ7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
RIMBP3CA6NJZ7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
RIMBP3CA6NJZ7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
RIMBP3CA6NJZ7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
RIMBP3CA6NJZ7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
RIMBP3CA6NJZ7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
RIMBP3CA6NJZ7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
RIMBP3CA6NJZ7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
RIMBP3CA6NJZ7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
RIMBP3CA6NJZ7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
RIMBP3CA6NJZ7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC43.03■■■■■ 4.48
RIMBP3CA6NJZ7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
RIMBP3CA6NJZ7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
RIMBP3CA6NJZ7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
RIMBP3CA6NJZ7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
RIMBP3CA6NJZ7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
RIMBP3CA6NJZ7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
RIMBP3CA6NJZ7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
RIMBP3CA6NJZ7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
RIMBP3CA6NJZ7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
RIMBP3CA6NJZ7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
RIMBP3CA6NJZ7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
RIMBP3CA6NJZ7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
RIMBP3CA6NJZ7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC42.96■■■■■ 4.47
RIMBP3CA6NJZ7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
RIMBP3CA6NJZ7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
RIMBP3CA6NJZ7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
RIMBP3CA6NJZ7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
RIMBP3CA6NJZ7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
RIMBP3CA6NJZ7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
RIMBP3CA6NJZ7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
RIMBP3CA6NJZ7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
RIMBP3CA6NJZ7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC42.93■■■■■ 4.46
RIMBP3CA6NJZ7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
RIMBP3CA6NJZ7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.93■■■■■ 4.46
RIMBP3CA6NJZ7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC42.92■■■■■ 4.46
RIMBP3CA6NJZ7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
RIMBP3CA6NJZ7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
RIMBP3CA6NJZ7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
RIMBP3CA6NJZ7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
RIMBP3CA6NJZ7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
RIMBP3CA6NJZ7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
RIMBP3CA6NJZ7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
RIMBP3CA6NJZ7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
RIMBP3CA6NJZ7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
RIMBP3CA6NJZ7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
RIMBP3CA6NJZ7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
RIMBP3CA6NJZ7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
RIMBP3CA6NJZ7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
RIMBP3CA6NJZ7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
RIMBP3CA6NJZ7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
RIMBP3CA6NJZ7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
RIMBP3CA6NJZ7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
RIMBP3CA6NJZ7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
RIMBP3CA6NJZ7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
RIMBP3CA6NJZ7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
RIMBP3CA6NJZ7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
RIMBP3CA6NJZ7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
RIMBP3CA6NJZ7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
RIMBP3CA6NJZ7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
RIMBP3CA6NJZ7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
RIMBP3CA6NJZ7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
RIMBP3CA6NJZ7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
RIMBP3CA6NJZ7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
RIMBP3CA6NJZ7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
RIMBP3CA6NJZ7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
RIMBP3CA6NJZ7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
RIMBP3CA6NJZ7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC42.73■■■■■ 4.43
RIMBP3CA6NJZ7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
RIMBP3CA6NJZ7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
RIMBP3CA6NJZ7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
RIMBP3CA6NJZ7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
RIMBP3CA6NJZ7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
RIMBP3CA6NJZ7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
RIMBP3CA6NJZ7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC42.68■■■■■ 4.42
RIMBP3CA6NJZ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
RIMBP3CA6NJZ7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
RIMBP3CA6NJZ7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
RIMBP3CA6NJZ7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
RIMBP3CA6NJZ7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms