Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GOLGA6L4A6NEF3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GOLGA6L4A6NEF3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GOLGA6L4A6NEF3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GOLGA6L4A6NEF3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLGA6L4A6NEF3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLGA6L4A6NEF3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA6L4A6NEF3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA6L4A6NEF3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA6L4A6NEF3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA6L4A6NEF3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLGA6L4A6NEF3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLGA6L4A6NEF3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLGA6L4A6NEF3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLGA6L4A6NEF3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLGA6L4A6NEF3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GOLGA6L4A6NEF3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GOLGA6L4A6NEF3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GOLGA6L4A6NEF3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA6L4A6NEF3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA6L4A6NEF3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA6L4A6NEF3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA6L4A6NEF3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLGA6L4A6NEF3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLGA6L4A6NEF3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLGA6L4A6NEF3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLGA6L4A6NEF3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLGA6L4A6NEF3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLGA6L4A6NEF3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLGA6L4A6NEF3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GOLGA6L4A6NEF3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GOLGA6L4A6NEF3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLGA6L4A6NEF3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLGA6L4A6NEF3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GOLGA6L4A6NEF3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GOLGA6L4A6NEF3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLGA6L4A6NEF3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLGA6L4A6NEF3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLGA6L4A6NEF3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GOLGA6L4A6NEF3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GOLGA6L4A6NEF3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GOLGA6L4A6NEF3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GOLGA6L4A6NEF3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GOLGA6L4A6NEF3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GOLGA6L4A6NEF3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GOLGA6L4A6NEF3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GOLGA6L4A6NEF3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms