Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVG6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVG6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1B0GVG6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1B0GVG6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1B0GVG6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1B0GVG6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1B0GVG6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1B0GVG6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1B0GVG6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1B0GVG6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1B0GVG6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1B0GVG6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1B0GVG6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1B0GVG6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A1B0GVG6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A1B0GVG6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A1B0GVG6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A1B0GVG6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A1B0GVG6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A1B0GVG6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A1B0GVG6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1B0GVG6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1B0GVG6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1B0GVG6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1B0GVG6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1B0GVG6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1B0GVG6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1B0GVG6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1B0GVG6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1B0GVG6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1B0GVG6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1B0GVG6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1B0GVG6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1B0GVG6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1B0GVG6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1B0GVG6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1B0GVG6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms