Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2E1P29083 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2E1P29083 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms