RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328739.5

VMO1-201, Transcript of vitelline membrane outer layer 1 homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VMO1, Length 766 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMO1-201ENST00000328739 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.13■■■■■ 5.14
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VMO1-201ENST00000328739 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.43■■■■□ 3.9
VMO1-201ENST00000328739 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.32■■■■□ 3.89
VMO1-201ENST00000328739 NACADO15069 1562 aa39.1■■■■□ 3.85
VMO1-201ENST00000328739 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.06■■■■□ 3.84
VMO1-201ENST00000328739 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.93■■■■□ 3.82
VMO1-201ENST00000328739 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.92■■■■□ 3.82
VMO1-201ENST00000328739 SCRIBQ14160 1630 aa38.16■■■■□ 3.7
VMO1-201ENST00000328739 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.14■■■■□ 3.7
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VMO1-201ENST00000328739 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.63■■■■□ 3.61
VMO1-201ENST00000328739 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.03■■■■□ 3.52
VMO1-201ENST00000328739 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
VMO1-201ENST00000328739 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.77■■■■□ 3.48
VMO1-201ENST00000328739 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.66■■■■□ 3.46
VMO1-201ENST00000328739 SMARCA4P51532 1647 aa36.47■■■■□ 3.43
VMO1-201ENST00000328739 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
VMO1-201ENST00000328739 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.38■■■■□ 3.41
VMO1-201ENST00000328739 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.24■■■■□ 3.39
VMO1-201ENST00000328739 SMARCA2P51531 1590 aa36.13■■■■□ 3.37
VMO1-201ENST00000328739 NCAPD3P42695 1498 aa36.12■■■■□ 3.37
VMO1-201ENST00000328739 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
VMO1-201ENST00000328739 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.06■■■■□ 3.36
VMO1-201ENST00000328739 WIZO95785 1651 aa35.98■■■■□ 3.35
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VMO1-201ENST00000328739 NESP48681 1621 aa35.24■■■■□ 3.23
VMO1-201ENST00000328739 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.23■■■■□ 3.23
VMO1-201ENST00000328739 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.13■■■■□ 3.21
VMO1-201ENST00000328739 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.05■■■■□ 3.2
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VMO1-201ENST00000328739 ERCC6Q03468 1493 aa34.91■■■■□ 3.18
VMO1-201ENST00000328739 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.88■■■■□ 3.17
VMO1-201ENST00000328739 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.72■■■■□ 3.15
VMO1-201ENST00000328739 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.71■■■■□ 3.15
VMO1-201ENST00000328739 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.62■■■■□ 3.13
VMO1-201ENST00000328739 PRDM2Q13029 1718 aa34.56■■■■□ 3.12
VMO1-201ENST00000328739 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
VMO1-201ENST00000328739 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.5■■■■□ 3.11
VMO1-201ENST00000328739 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
VMO1-201ENST00000328739 WDR62O43379 1518 aa34.35■■■■□ 3.09
VMO1-201ENST00000328739 CUX2O14529 1486 aa34.34■■■■□ 3.09
VMO1-201ENST00000328739 TOPBP1Q92547 1522 aa34.2■■■■□ 3.07
VMO1-201ENST00000328739 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.15■■■■□ 3.06
VMO1-201ENST00000328739 ABCC8Q09428 1581 aa34.14■■■■□ 3.06
VMO1-201ENST00000328739 CUX1P39880 1505 aa34.09■■■■□ 3.05
VMO1-201ENST00000328739 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.01■■■■□ 3.03
VMO1-201ENST00000328739 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.02
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VMO1-201ENST00000328739 SYNJ1O43426 1573 aa33.89■■■■□ 3.02
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VMO1-201ENST00000328739 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.86■■■■□ 3.01
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VMO1-201ENST00000328739 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.79■■■■□ 3
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VMO1-201ENST00000328739 WDR97A6NE52 1622 aa33.52■■■□□ 2.96
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VMO1-201ENST00000328739 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.37■■■□□ 2.93
VMO1-201ENST00000328739 GRIN2BQ13224 1484 aa33.36■■■□□ 2.93
VMO1-201ENST00000328739 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.3■■■□□ 2.92
VMO1-201ENST00000328739 KIF27Q86VH2 1401 aa33.26■■■□□ 2.91
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VMO1-201ENST00000328739 EEA1Q15075 1411 aa32.8■■■□□ 2.84
VMO1-201ENST00000328739 NUP160Q12769 1436 aa32.77■■■□□ 2.84
VMO1-201ENST00000328739 CEP170Q5SW79 1584 aa32.76■■■□□ 2.84
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VMO1-201ENST00000328739 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.72■■■□□ 2.83
VMO1-201ENST00000328739 PRXQ9BXM0 1461 aa32.71■■■□□ 2.83
VMO1-201ENST00000328739 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.54■■■□□ 2.8
VMO1-201ENST00000328739 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.53■■■□□ 2.8
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