Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 HSP90AB1-203ENST00000371646 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.676e-18■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 HSP90AB1-202ENST00000371554 2674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.76e-18■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 HSP90AB1-201ENST00000353801 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.856e-18■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 HSP90AB1-204ENST00000620073 2644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.96e-18■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 CHD7-204ENST00000526846 500 ntTSL 215.9■□□□□ 0.142e-7■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 ZNF318-202ENST00000605935 3836 ntTSL 1 (best)15.8■□□□□ 0.125e-6■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.125e-6■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 ABCF1-204ENST00000468958 606 ntTSL 312.45□□□□□ -0.425e-6■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 ABCF1-202ENST00000376545 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.565e-6■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 ABCF1-201ENST00000326195 3481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.645e-6■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 ABCF1-203ENST00000441867 1074 ntTSL 59.29□□□□□ -0.925e-6■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 ZNF318-203ENST00000606599 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 26.22□□□□□ -1.415e-6■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 ABCF1-207ENST00000542772 223 ntTSL 35.84□□□□□ -1.475e-6■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 AL109615.3-201ENST00000422059 2232 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.685e-6■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.859e-8■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 GTPBP2-206ENST00000452781 681 ntTSL 520.28■□□□□ 0.849e-8■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.259e-8■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 KIAA0391-204ENST00000557404 789 ntTSL 314.01□□□□□ -0.179e-8■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.239e-8■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 KIAA0391-205ENST00000603544 2232 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.849e-8■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 KIAA0391-207ENST00000603611 603 ntTSL 28.98□□□□□ -0.979e-8■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 KIAA0391-206ENST00000603588 458 ntTSL 58.65□□□□□ -1.029e-8■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.129e-8■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.319e-8■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.369e-8■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 CASC19-242ENST00000641584 2114 nt6.52□□□□□ -1.379e-8■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.399e-8■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.641e-62■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 RAD21-201ENST00000297338 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.722e-7■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.512e-7■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.622e-7■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 HNRNPA2B1-206ENST00000490912 5328 ntTSL 216.91■□□□□ 0.39e-8■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 HNRNPA2B1-203ENST00000360787 1724 ntTSL 516.23■□□□□ 0.199e-8■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 HNRNPA2B1-204ENST00000463181 6284 ntTSL 216.03■□□□□ 0.169e-8■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 HNRNPA2B1-208ENST00000618183 3539 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.479e-8■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 HNRNPA2B1-202ENST00000356674 1711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.539e-8■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -19e-8■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.048e-16■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 MTUS1-217ENST00000520196 5205 ntTSL 1 (best)5.56□□□□□ -1.526e-11■□□□□ 8.8
HLTFQ14527 PCM1-205ENST00000517836 580 ntTSL 36.13□□□□□ -1.431e-7■□□□□ 8.7
HLTFQ14527 COX19-202ENST00000457254 1420 ntTSL 216.59■□□□□ 0.252e-10■□□□□ 8.7
HLTFQ14527 COX19-201ENST00000344111 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.412e-10■□□□□ 8.7
HLTFQ14527 MARCH7-209ENST00000539065 3303 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.346e-7■□□□□ 8.7
HLTFQ14527 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.296e-7■□□□□ 8.7
HLTFQ14527 MARCH7-206ENST00000461582 292 ntTSL 34.05□□□□□ -1.766e-7■□□□□ 8.7
HLTFQ14527 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.836e-7■□□□□ 8.7
HLTFQ14527 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.016e-7■□□□□ 8.7
HLTFQ14527 HECTD1-204ENST00000553957 4395 ntTSL 24.91□□□□□ -1.626e-21■□□□□ 8.7
HLTFQ14527 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.899e-36■□□□□ 8.7
HLTFQ14527 DLC1-205ENST00000506171 560 ntTSL 45.85□□□□□ -1.474e-7■□□□□ 8.7
HLTFQ14527 ANKHD1-210ENST00000432301 3234 ntTSL 1 (best)8.7□□□□□ -1.024e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.945e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 CHD7-202ENST00000524602 3456 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.965e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.043e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 POLR3GL-203ENST00000471706 755 ntTSL 521.55■■□□□ 1.043e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.23e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 POLR3GL-204ENST00000622508 1600 ntTSL 1 (best)14.2□□□□□ -0.143e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.362e-9■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 HNRNPM-208ENST00000597270 1147 ntTSL 220.33■□□□□ 0.852e-9■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.82e-9■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 HNRNPM-214ENST00000600806 2373 ntTSL 519.59■□□□□ 0.732e-9■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 HNRNPM-204ENST00000594907 1078 ntTSL 519.08■□□□□ 0.642e-9■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.62e-9■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 HNRNPM-213ENST00000600092 1086 ntTSL 218.46■□□□□ 0.552e-9■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 HNRNPM-210ENST00000598367 298 ntTSL 510.09□□□□□ -0.792e-9■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.051e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 SRSF4-202ENST00000466448 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.91■□□□□ 0.621e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.332e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.156e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.436e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.126e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.056e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 PMS1-211ENST00000424766 831 ntTSL 320.3■□□□□ 0.846e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 BRD4-207ENST00000595926 582 ntTSL 219.82■□□□□ 0.766e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.746e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.556e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.496e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 UBE2I-208ENST00000473256 1771 ntTSL 217.89■□□□□ 0.456e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 UBE2I-212ENST00000566159 2642 nt17.28■□□□□ 0.366e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 CBX4-204ENST00000495122 490 ntTSL 317.09■□□□□ 0.336e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.016e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 UBE2I-211ENST00000564143 444 ntTSL 313.49□□□□□ -0.256e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 ZSCAN30-202ENST00000420878 4323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.276e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 BRD4-203ENST00000371835 4624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.296e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 BRD4-201ENST00000263377 7169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.366e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 ZSCAN30-211ENST00000610712 3439 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.666e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 ZSCAN30-205ENST00000589178 3368 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.686e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.76e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 ZSCAN30-201ENST00000333206 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.826e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 ANKHD1-EIF4EBP3-201ENST00000437495 2243 ntTSL 59.41□□□□□ -0.96e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 SH3D19-209ENST00000514013 557 ntTSL 49.15□□□□□ -0.946e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 SH3D19-202ENST00000409252 4888 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.966e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 SH3D19-206ENST00000474743 659 ntTSL 48.36□□□□□ -1.076e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.096e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.126e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 ANKHD1-EIF4EBP3-202ENST00000474060 5446 ntTSL 27.04□□□□□ -1.286e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.326e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 PMS1-216ENST00000447734 570 ntTSL 54.99□□□□□ -1.616e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.026e-7■□□□□ 8.6
HLTFQ14527 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.876e-8■□□□□ 8.6
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