RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557404.3

KIAA0391-204, Transcript of KIAA0391, humanhuman

TSL 3

Gene KIAA0391, Length 789 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0391-204ENST00000557404 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.84■■■■□ 3.01
KIAA0391-204ENST00000557404 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.79■■■□□ 2.36
KIAA0391-204ENST00000557404 ABCC9O60706 1549 aa28.7■■■□□ 2.19
KIAA0391-204ENST00000557404 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
KIAA0391-204ENST00000557404 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.02■■■□□ 2.08
KIAA0391-204ENST00000557404 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.95■■■□□ 2.06
KIAA0391-204ENST00000557404 NACADO15069 1562 aa27.89■■■□□ 2.05
KIAA0391-204ENST00000557404 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.83■■■□□ 2.05
KIAA0391-204ENST00000557404 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.75■■■□□ 2.03
KIAA0391-204ENST00000557404 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.3■■□□□ 1.96
KIAA0391-204ENST00000557404 SCRIBQ14160 1630 aa27.23■■□□□ 1.95
KIAA0391-204ENST00000557404 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.13■■□□□ 1.93
KIAA0391-204ENST00000557404 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.93■■□□□ 1.9
KIAA0391-204ENST00000557404 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.9
KIAA0391-204ENST00000557404 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.42■■□□□ 1.82
KIAA0391-204ENST00000557404 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.38■■□□□ 1.81
KIAA0391-204ENST00000557404 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
KIAA0391-204ENST00000557404 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.13■■□□□ 1.77
KIAA0391-204ENST00000557404 SMARCA4P51532 1647 aa26.13■■□□□ 1.77
KIAA0391-204ENST00000557404 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
KIAA0391-204ENST00000557404 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.02■■□□□ 1.76
KIAA0391-204ENST00000557404 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
KIAA0391-204ENST00000557404 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.92■■□□□ 1.74
KIAA0391-204ENST00000557404 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.89■■□□□ 1.73
KIAA0391-204ENST00000557404 WIZO95785 1651 aa25.84■■□□□ 1.73
KIAA0391-204ENST00000557404 NCAPD3P42695 1498 aa25.8■■□□□ 1.72
KIAA0391-204ENST00000557404 SMARCA2P51531 1590 aa25.77■■□□□ 1.72
KIAA0391-204ENST00000557404 HMGXB3Q12766 1538 aa25.67■■□□□ 1.7
KIAA0391-204ENST00000557404 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
KIAA0391-204ENST00000557404 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
KIAA0391-204ENST00000557404 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
KIAA0391-204ENST00000557404 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.3■■□□□ 1.64
KIAA0391-204ENST00000557404 NESP48681 1621 aa25.07■■□□□ 1.6
KIAA0391-204ENST00000557404 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.03■■□□□ 1.6
KIAA0391-204ENST00000557404 CFTRP13569 1480 aa25.02■■□□□ 1.6
KIAA0391-204ENST00000557404 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.95■■□□□ 1.58
KIAA0391-204ENST00000557404 PRDM2Q13029 1718 aa24.8■■□□□ 1.56
KIAA0391-204ENST00000557404 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.73■■□□□ 1.55
KIAA0391-204ENST00000557404 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.72■■□□□ 1.55
KIAA0391-204ENST00000557404 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.71■■□□□ 1.55
KIAA0391-204ENST00000557404 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.58■■□□□ 1.53
KIAA0391-204ENST00000557404 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
KIAA0391-204ENST00000557404 ERCC6Q03468 1493 aa24.55■■□□□ 1.52
KIAA0391-204ENST00000557404 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
KIAA0391-204ENST00000557404 ABCC8Q09428 1581 aa24.5■■□□□ 1.51
KIAA0391-204ENST00000557404 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.49■■□□□ 1.51
KIAA0391-204ENST00000557404 CUX1P39880 1505 aa24.47■■□□□ 1.51
KIAA0391-204ENST00000557404 WDR62O43379 1518 aa24.45■■□□□ 1.51
KIAA0391-204ENST00000557404 CUX2O14529 1486 aa24.45■■□□□ 1.51
KIAA0391-204ENST00000557404 TOPBP1Q92547 1522 aa24.42■■□□□ 1.5
KIAA0391-204ENST00000557404 SYNJ1O43426 1573 aa24.41■■□□□ 1.5
KIAA0391-204ENST00000557404 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.4■■□□□ 1.5
KIAA0391-204ENST00000557404 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.49
KIAA0391-204ENST00000557404 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.34■■□□□ 1.49
KIAA0391-204ENST00000557404 TOP2BQ02880 1626 aa24.33■■□□□ 1.49
KIAA0391-204ENST00000557404 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
KIAA0391-204ENST00000557404 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.24■■□□□ 1.47
KIAA0391-204ENST00000557404 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.24■■□□□ 1.47
KIAA0391-204ENST00000557404 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
KIAA0391-204ENST00000557404 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.17■■□□□ 1.46
KIAA0391-204ENST00000557404 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.13■■□□□ 1.45
KIAA0391-204ENST00000557404 SOGA1O94964 1423 aa24.1■■□□□ 1.45
KIAA0391-204ENST00000557404 WDR97A6NE52 1622 aa24.09■■□□□ 1.45
KIAA0391-204ENST00000557404 IFT140Q96RY7 1462 aa24.08■■□□□ 1.45
KIAA0391-204ENST00000557404 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
KIAA0391-204ENST00000557404 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.05■■□□□ 1.44
KIAA0391-204ENST00000557404 TRIM41Q8WV44 630 aa24.04■■□□□ 1.44
KIAA0391-204ENST00000557404 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
KIAA0391-204ENST00000557404 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.94■■□□□ 1.42
KIAA0391-204ENST00000557404 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.94■■□□□ 1.42
KIAA0391-204ENST00000557404 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.94■■□□□ 1.42
KIAA0391-204ENST00000557404 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
KIAA0391-204ENST00000557404 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.82■■□□□ 1.4
KIAA0391-204ENST00000557404 IGF1RP08069 1367 aa23.78■■□□□ 1.4
KIAA0391-204ENST00000557404 KIF27Q86VH2 1401 aa23.78■■□□□ 1.4
KIAA0391-204ENST00000557404 PBRM1Q86U86 1689 aa23.76■■□□□ 1.39
KIAA0391-204ENST00000557404 GRIN2BQ13224 1484 aa23.75■■□□□ 1.39
KIAA0391-204ENST00000557404 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.73■■□□□ 1.39
KIAA0391-204ENST00000557404 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.68■■□□□ 1.38
KIAA0391-204ENST00000557404 ADAMTS12P58397 1594 aa23.64■■□□□ 1.37
KIAA0391-204ENST00000557404 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
KIAA0391-204ENST00000557404 EEA1Q15075 1411 aa23.62■■□□□ 1.37
KIAA0391-204ENST00000557404 PRXQ9BXM0 1461 aa23.61■■□□□ 1.37
KIAA0391-204ENST00000557404 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.58■■□□□ 1.37
KIAA0391-204ENST00000557404 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.57■■□□□ 1.36
KIAA0391-204ENST00000557404 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
KIAA0391-204ENST00000557404 CUL7Q14999 1698 aa23.55■■□□□ 1.36
KIAA0391-204ENST00000557404 SYNJ2O15056 1496 aa23.55■■□□□ 1.36
KIAA0391-204ENST00000557404 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.54■■□□□ 1.36
KIAA0391-204ENST00000557404 CHD1O14646 1710 aa23.5■■□□□ 1.35
KIAA0391-204ENST00000557404 GRIN2AQ12879 1464 aa23.47■■□□□ 1.35
KIAA0391-204ENST00000557404 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.46■■□□□ 1.35
KIAA0391-204ENST00000557404 KIF21BO75037 1637 aa23.44■■□□□ 1.34
KIAA0391-204ENST00000557404 NUP160Q12769 1436 aa23.42■■□□□ 1.34
KIAA0391-204ENST00000557404 CEP170Q5SW79 1584 aa23.4■■□□□ 1.34
KIAA0391-204ENST00000557404 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
KIAA0391-204ENST00000557404 FBLN2P98095 1184 aa23.35■■□□□ 1.33
KIAA0391-204ENST00000557404 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.33■■□□□ 1.33
KIAA0391-204ENST00000557404 GOLGA3Q08378 1498 aa23.28■■□□□ 1.32
KIAA0391-204ENST00000557404 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.3 ms