Protein–RNA interactions for Protein: Q12347

HRT3, F-box protein HRT3, yeastyeast

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRT3Q12347 RTP1YMR185W 2946 nt1.86□□□□□ -2.11
HRT3Q12347 VPS34YLR240W 2628 nt1.85□□□□□ -2.11
HRT3Q12347 YCR022CYCR022C 345 nt1.85□□□□□ -2.11
HRT3Q12347 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt1.85□□□□□ -2.11
HRT3Q12347 YBR277CYBR277C 402 nt1.85□□□□□ -2.11
HRT3Q12347 YOR093CYOR093C 4947 nt1.85□□□□□ -2.11
HRT3Q12347 YEL043WYEL043W 2871 nt1.84□□□□□ -2.11
HRT3Q12347 YBP1YBR216C 2025 nt1.84□□□□□ -2.11
HRT3Q12347 VPS16YPL045W 2397 nt1.84□□□□□ -2.11
HRT3Q12347 YDR008CYDR008C 351 nt1.84□□□□□ -2.11
HRT3Q12347 FMP16YDR070C 282 nt1.84□□□□□ -2.11
HRT3Q12347 YGL239CYGL239C 315 nt1.84□□□□□ -2.11
HRT3Q12347 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.84□□□□□ -2.11
HRT3Q12347 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.84□□□□□ -2.11
HRT3Q12347 YPL229WYPL229W 621 nt1.84□□□□□ -2.11
HRT3Q12347 PRK1YIL095W 2433 nt1.83□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 RTT107YHR154W 3213 nt1.83□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 AGC1YPR021C 2709 nt1.83□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 HSH155YMR288W 2916 nt1.83□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 TIM13YGR181W 318 nt1.83□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 NOP10YHR072W-A 177 nt1.83□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 SGD1YLR336C 2700 nt1.83□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 DOT6YER088C 2013 nt1.83□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 AIM9YER080W 1884 nt1.82□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 SOK2YMR016C 2358 nt1.82□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 MYO2YOR326W 4725 nt1.82□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 VPS35YJL154C 2835 nt1.81□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 snR65snR65 100 nt1.81□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 SMD1YGR074W 441 nt1.81□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 PHS1YJL097W 654 nt1.81□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 YOR282WYOR282W 321 nt1.81□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 SNC2YOR327C 348 nt1.81□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 YMR045CYMR045C 5268 nt1.81□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 STE5YDR103W 2754 nt1.8□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 HSK3YKL138C-A 210 nt1.8□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 RPL32YBL092W 393 nt1.8□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.8□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.8□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 YPR099CYPR099C 357 nt1.8□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 LYS9YNR050C 1341 nt1.8□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 RRP6YOR001W 2202 nt1.79□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 SNC1YAL030W 354 nt1.79□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 YAR029WYAR029W 225 nt1.79□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 TRM3YDL112W 4311 nt1.79□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 PAC1YOR269W 1485 nt1.79□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 SGO1YOR073W 1773 nt1.79□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 RKM1YPL208W 1752 nt1.79□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 NOT5YPR072W 1683 nt1.78□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 RBK1YCR036W 1002 nt1.78□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 CSN9YDR179C 489 nt1.78□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 YGL069CYGL069C 465 nt1.78□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 RPL39YJL189W 156 nt1.78□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 RPS27AYKL156W 249 nt1.78□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 VMR1YHL035C 4779 nt1.78□□□□□ -2.12
HRT3Q12347 RPL35AYDL191W 363 nt1.77□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 YDR366CYDR366C 399 nt1.77□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.77□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 YBR224WYBR224W 516 nt1.77□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 PAN3YKL025C 2040 nt1.77□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 UTP21YLR409C 2820 nt1.76□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 FIG2YCR089W 4830 nt1.76□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 UBR2YLR024C 5619 nt1.76□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.76□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 YHL041WYHL041W 450 nt1.76□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 COA6YMR244C-A 315 nt1.76□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 CFT1YDR301W 4074 nt1.76□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 IST2YBR086C 2841 nt1.75□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.75□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 YFL063WYFL063W 456 nt1.75□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 IRC20YLR247C 4671 nt1.75□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 TOF2YKR010C 2316 nt1.74□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.74□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 SFB2YNL049C 2631 nt1.74□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 DNF3YMR162C 4971 nt1.74□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 SNF5YBR289W 2718 nt1.74□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 SPO22YIL073C 2928 nt1.73□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 RIC1YLR039C 3171 nt1.73□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 VPS8YAL002W 3825 nt1.73□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 LRE1YCL051W 1752 nt1.73□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt1.73□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.73□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 SAR1YPL218W 573 nt1.73□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 NUP192YJL039C 5052 nt1.73□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 DFG16YOR030W 1860 nt1.73□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 CDC27YBL084C 2277 nt1.73□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 CDC60YPL160W 3273 nt1.72□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 YBR184WYBR184W 1572 nt1.72□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 PEP3YLR148W 2757 nt1.72□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 CRM1YGR218W 3255 nt1.72□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 STB4YMR019W 2850 nt1.72□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 YHR210CYHR210C 1026 nt1.72□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 RPA34YJL148W 702 nt1.72□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 TAR1YLR154W-C 375 nt1.72□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 YLR149CYLR149C 2193 nt1.72□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 SMY1YKL079W 1971 nt1.72□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 VPH1YOR270C 2523 nt1.72□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 SEF1YBL066C 3447 nt1.72□□□□□ -2.13
HRT3Q12347 RTT101YJL047C 2529 nt1.71□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 YDR048CYDR048C 315 nt1.71□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 YGL149WYGL149W 306 nt1.71□□□□□ -2.14
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