Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 ZNF217-202ENST00000371471 5796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.643e-7■□□□□ 9.2
HLTFQ14527 RBM39-236ENST00000490484 871 ntTSL 510.32□□□□□ -0.766e-21■□□□□ 9.2
HLTFQ14527 REV1-215ENST00000486117 582 ntTSL 27.43□□□□□ -1.222e-7■□□□□ 9.2
HLTFQ14527 RBM39-239ENST00000494274 704 ntTSL 37.17□□□□□ -1.266e-21■□□□□ 9.2
HLTFQ14527 RBM39-237ENST00000492779 2316 ntTSL 27.11□□□□□ -1.276e-21■□□□□ 9.2
HLTFQ14527 U2SURP-211ENST00000488497 3557 ntTSL 1 (best)6.46□□□□□ -1.382e-7■□□□□ 9.2
HLTFQ14527 REV1-216ENST00000491752 547 ntTSL 46.27□□□□□ -1.412e-7■□□□□ 9.2
HLTFQ14527 RBM39-244ENST00000615771 686 ntTSL 56.14□□□□□ -1.436e-21■□□□□ 9.2
HLTFQ14527 MIPOL1-208ENST00000554114 595 ntTSL 36.11□□□□□ -1.432e-7■□□□□ 9.2
HLTFQ14527 RBM39-217ENST00000448303 1008 ntTSL 55.72□□□□□ -1.496e-21■□□□□ 9.2
HLTFQ14527 REV1-205ENST00000450415 577 ntTSL 45.16□□□□□ -1.582e-7■□□□□ 9.2
HLTFQ14527 REV1-213ENST00000482887 427 ntTSL 35.16□□□□□ -1.582e-7■□□□□ 9.2
HLTFQ14527 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.592e-7■□□□□ 9.2
HLTFQ14527 U2SURP-207ENST00000472373 1182 ntTSL 24.87□□□□□ -1.632e-7■□□□□ 9.2
HLTFQ14527 RBM39-229ENST00000475651 555 ntTSL 54.52□□□□□ -1.696e-21■□□□□ 9.2
HLTFQ14527 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.72e-7■□□□□ 9.2
HLTFQ14527 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.766e-21■□□□□ 9.2
HLTFQ14527 U2SURP-209ENST00000480029 2855 ntTSL 23.73□□□□□ -1.812e-7■□□□□ 9.2
HLTFQ14527 RBM39-221ENST00000461283 2415 ntTSL 53.56□□□□□ -1.846e-21■□□□□ 9.2
HLTFQ14527 U2SURP-203ENST00000463563 4364 ntTSL 23.21□□□□□ -1.92e-7■□□□□ 9.2
HLTFQ14527 MIPOL1-205ENST00000539174 2888 ntTSL 1 (best)0.1□□□□□ -2.392e-7■□□□□ 9.2
HLTFQ14527 ITPR2-209ENST00000545235 540 ntTSL 1 (best)8.43□□□□□ -1.066e-8■□□□□ 9.2
HLTFQ14527 CETN3-201ENST00000283122 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.371e-7■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 CETN3-203ENST00000522083 1026 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.541e-7■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 CETN3-204ENST00000522565 867 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.541e-7■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 SEC62-207ENST00000480708 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.051e-7■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 CETN3-202ENST00000518458 610 ntTSL 37.53□□□□□ -1.21e-7■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.231e-7■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 SEC62-208ENST00000481435 627 ntTSL 26.81□□□□□ -1.321e-7■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 SEC62-204ENST00000469515 785 ntTSL 36.4□□□□□ -1.381e-7■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.461e-7■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 SEC62-202ENST00000460513 641 ntTSL 55.15□□□□□ -1.591e-7■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 SEC62-205ENST00000469890 822 ntTSL 24.93□□□□□ -1.621e-7■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 SMARCA1-201ENST00000371121 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.361e-13■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 SMARCA1-205ENST00000617310 4291 ntTSL 211.41□□□□□ -0.581e-13■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 SMARCA1-202ENST00000371122 4099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.751e-13■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 SMARCA1-203ENST00000371123 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.861e-13■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 ZFYVE16-205ENST00000509562 684 ntTSL 39.38□□□□□ -0.912e-9■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 TRAPPC12-209ENST00000441099 698 ntTSL 315.77■□□□□ 0.122e-6■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.028e-7■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 TRAPPC12-210ENST00000441983 683 ntTSL 314.94□□□□□ -0.022e-6■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.048e-7■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.078e-7■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 NUMA1-202ENST00000358965 7227 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.328e-7■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 TRAPPC12-218ENST00000479897 454 ntTSL 312.58□□□□□ -0.42e-6■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 TRAPPC12-219ENST00000479955 420 ntTSL 311.8□□□□□ -0.522e-6■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 NUMA1-201ENST00000351960 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.778e-7■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 NUMA1-232ENST00000613205 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.948e-7■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 TRAPPC12-214ENST00000462983 543 ntTSL 49.09□□□□□ -0.952e-6■□□□□ 9.1
HLTFQ14527 DGKD-210ENST00000474488 1355 ntTSL 517.71■□□□□ 0.435e-8■□□□□ 9
HLTFQ14527 GIGYF2-202ENST00000409196 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.565e-8■□□□□ 9
HLTFQ14527 GIGYF2-203ENST00000409451 5937 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.645e-8■□□□□ 9
HLTFQ14527 GIGYF2-228ENST00000469843 550 ntTSL 410.72□□□□□ -0.695e-8■□□□□ 9
HLTFQ14527 GIGYF2-205ENST00000409547 5978 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.715e-8■□□□□ 9
HLTFQ14527 GIGYF2-204ENST00000409480 5976 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.725e-8■□□□□ 9
HLTFQ14527 GIGYF2-201ENST00000373563 5847 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.85e-8■□□□□ 9
HLTFQ14527 GIGYF2-231ENST00000474312 4687 ntTSL 27.76□□□□□ -1.175e-8■□□□□ 9
HLTFQ14527 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.265e-8■□□□□ 9
HLTFQ14527 COL27A1-202ENST00000451716 2865 ntTSL 1 (best)13.01□□□□□ -0.332e-7■□□□□ 9
HLTFQ14527 GCC2-212ENST00000485546 610 ntTSL 57.21□□□□□ -1.262e-16■□□□□ 9
HLTFQ14527 REV1-207ENST00000465835 3172 ntTSL 55.2□□□□□ -1.581e-7■□□□□ 9
HLTFQ14527 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.084e-19■□□□□ 9
HLTFQ14527 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.144e-19■□□□□ 9
HLTFQ14527 HSP90AA1-204ENST00000554401 1710 ntTSL 1 (best)9□□□□□ -0.974e-19■□□□□ 9
HLTFQ14527 HSP90AA1-210ENST00000560130 488 ntTSL 25.48□□□□□ -1.534e-19■□□□□ 9
HLTFQ14527 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.036e-12■□□□□ 9
HLTFQ14527 UQCRB-205ENST00000518876 3968 ntTSL 1 (best)7.48□□□□□ -1.216e-12■□□□□ 9
HLTFQ14527 UQCRB-207ENST00000521036 982 ntTSL 26.74□□□□□ -1.336e-12■□□□□ 9
HLTFQ14527 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.456e-12■□□□□ 9
HLTFQ14527 UQCRB-203ENST00000517603 1041 ntTSL 1 (best)5.5□□□□□ -1.536e-12■□□□□ 9
HLTFQ14527 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.846e-12■□□□□ 9
HLTFQ14527 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.453e-7■□□□□ 9
HLTFQ14527 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.023e-7■□□□□ 9
HLTFQ14527 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.863e-7■□□□□ 9
HLTFQ14527 UBE2I-215ENST00000567074 884 ntTSL 1 (best)19.04■□□□□ 0.643e-7■□□□□ 9
HLTFQ14527 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.553e-7■□□□□ 9
HLTFQ14527 UBE2I-218ENST00000568288 501 ntTSL 517.46■□□□□ 0.393e-7■□□□□ 9
HLTFQ14527 UBE2I-217ENST00000568209 266 ntTSL 517.32■□□□□ 0.363e-7■□□□□ 9
HLTFQ14527 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.223e-7■□□□□ 9
HLTFQ14527 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.053e-7■□□□□ 9
HLTFQ14527 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.063e-7■□□□□ 9
HLTFQ14527 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.083e-7■□□□□ 9
HLTFQ14527 UBE2I-214ENST00000566775 396 ntTSL 38.48□□□□□ -1.053e-7■□□□□ 9
HLTFQ14527 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.72e-9■□□□□ 9
HLTFQ14527 D2HGDH-215ENST00000486953 2232 ntTSL 1 (best)25.56■■□□□ 1.682e-9■□□□□ 9
HLTFQ14527 D2HGDH-214ENST00000473126 1612 ntTSL 1 (best)24.92■■□□□ 1.582e-9■□□□□ 9
HLTFQ14527 D2HGDH-202ENST00000400769 2277 ntTSL 224.79■■□□□ 1.562e-9■□□□□ 9
HLTFQ14527 D2HGDH-212ENST00000468064 2298 ntTSL 1 (best)24.79■■□□□ 1.562e-9■□□□□ 9
HLTFQ14527 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.292e-9■□□□□ 9
HLTFQ14527 D2HGDH-206ENST00000436747 4549 ntTSL 1 (best)19.32■□□□□ 0.682e-9■□□□□ 9
HLTFQ14527 SRSF4-208ENST00000634348 8128 ntTSL 513.14□□□□□ -0.312e-9■□□□□ 9
HLTFQ14527 SF3B2-201ENST00000322535 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.622e-9■□□□□ 9
HLTFQ14527 SF3B2-206ENST00000528302 3254 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.662e-9■□□□□ 9
HLTFQ14527 SF3B2-210ENST00000530981 1080 ntTSL 59.05□□□□□ -0.962e-9■□□□□ 9
HLTFQ14527 EHBP1-215ENST00000469591 886 ntTSL 55.02□□□□□ -1.612e-13■□□□□ 9
HLTFQ14527 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.181e-6■□□□□ 9
HLTFQ14527 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.071e-6■□□□□ 9
HLTFQ14527 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.21e-6■□□□□ 9
HLTFQ14527 CCDC88A-202ENST00000336838 9505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.541e-6■□□□□ 9
HLTFQ14527 CCDC88A-205ENST00000426576 4500 ntTSL 1 (best)2.49□□□□□ -2.011e-6■□□□□ 9
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