RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441099.5

TRAPPC12-209, Transcript of trafficking protein particle complex 12, humanhuman

TSL 3

Gene TRAPPC12, Length 698 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12-209ENST00000441099 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.79■■■■□ 3.8
TRAPPC12-209ENST00000441099 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.34■■■■□ 3.09
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TRAPPC12-209ENST00000441099 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.5■■■□□ 2.79
TRAPPC12-209ENST00000441099 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.45■■■□□ 2.78
TRAPPC12-209ENST00000441099 NACADO15069 1562 aa32.42■■■□□ 2.78
TRAPPC12-209ENST00000441099 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
TRAPPC12-209ENST00000441099 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.25■■■□□ 2.75
TRAPPC12-209ENST00000441099 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.08■■■□□ 2.73
TRAPPC12-209ENST00000441099 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.71■■■□□ 2.67
TRAPPC12-209ENST00000441099 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.51■■■□□ 2.63
TRAPPC12-209ENST00000441099 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.51■■■□□ 2.63
TRAPPC12-209ENST00000441099 SCRIBQ14160 1630 aa31.4■■■□□ 2.62
TRAPPC12-209ENST00000441099 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.26■■■□□ 2.59
TRAPPC12-209ENST00000441099 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.17■■■□□ 2.58
TRAPPC12-209ENST00000441099 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
TRAPPC12-209ENST00000441099 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.54■■■□□ 2.48
TRAPPC12-209ENST00000441099 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.43■■■□□ 2.46
TRAPPC12-209ENST00000441099 SMARCA4P51532 1647 aa30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC12-209ENST00000441099 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC12-209ENST00000441099 NCAPD3P42695 1498 aa30.01■■■□□ 2.4
TRAPPC12-209ENST00000441099 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30■■■□□ 2.39
TRAPPC12-209ENST00000441099 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC12-209ENST00000441099 SMARCA2P51531 1590 aa29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC12-209ENST00000441099 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.77■■■□□ 2.36
TRAPPC12-209ENST00000441099 HMGXB3Q12766 1538 aa29.76■■■□□ 2.36
TRAPPC12-209ENST00000441099 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
TRAPPC12-209ENST00000441099 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC12-209ENST00000441099 WIZO95785 1651 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC12-209ENST00000441099 NESP48681 1621 aa29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC12-209ENST00000441099 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
TRAPPC12-209ENST00000441099 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC12-209ENST00000441099 ERCC6Q03468 1493 aa29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC12-209ENST00000441099 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC12-209ENST00000441099 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC12-209ENST00000441099 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC12-209ENST00000441099 CFTRP13569 1480 aa28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC12-209ENST00000441099 CUX2O14529 1486 aa28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC12-209ENST00000441099 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC12-209ENST00000441099 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC12-209ENST00000441099 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC12-209ENST00000441099 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC12-209ENST00000441099 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.7■■■□□ 2.18
TRAPPC12-209ENST00000441099 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC12-209ENST00000441099 WDR62O43379 1518 aa28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC12-209ENST00000441099 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC12-209ENST00000441099 PRDM2Q13029 1718 aa28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC12-209ENST00000441099 TOPBP1Q92547 1522 aa28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC12-209ENST00000441099 ABCC8Q09428 1581 aa28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC12-209ENST00000441099 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC12-209ENST00000441099 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC12-209ENST00000441099 IFT140Q96RY7 1462 aa28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC12-209ENST00000441099 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC12-209ENST00000441099 CUX1P39880 1505 aa28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC12-209ENST00000441099 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC12-209ENST00000441099 SOGA1O94964 1423 aa27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.89■■■□□ 2.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC12-209ENST00000441099 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 OSCARQ8IYS5 282 aa27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 TOP2BQ02880 1626 aa27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 SYNJ1O43426 1573 aa27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 WDR97A6NE52 1622 aa27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 GRIN2BQ13224 1484 aa27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC12-209ENST00000441099 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC12-209ENST00000441099 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC12-209ENST00000441099 FBLN2P98095 1184 aa27.56■■■□□ 2
TRAPPC12-209ENST00000441099 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
TRAPPC12-209ENST00000441099 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC12-209ENST00000441099 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC12-209ENST00000441099 SYNJ2O15056 1496 aa27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC12-209ENST00000441099 CHD1O14646 1710 aa27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC12-209ENST00000441099 PBRM1Q86U86 1689 aa27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC12-209ENST00000441099 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC12-209ENST00000441099 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC12-209ENST00000441099 KIF27Q86VH2 1401 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC12-209ENST00000441099 IGF1RP08069 1367 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC12-209ENST00000441099 ADAMTS12P58397 1594 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC12-209ENST00000441099 GRIN2AQ12879 1464 aa27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC12-209ENST00000441099 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC12-209ENST00000441099 ARHGEF11O15085 1522 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC12-209ENST00000441099 TRIM41Q8WV44 630 aa27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC12-209ENST00000441099 NUP160Q12769 1436 aa27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC12-209ENST00000441099 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC12-209ENST00000441099 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC12-209ENST00000441099 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC12-209ENST00000441099 CEP170Q5SW79 1584 aa27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC12-209ENST00000441099 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC12-209ENST00000441099 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC12-209ENST00000441099 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC12-209ENST00000441099 ARAP1Q96P48 1450 aa27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC12-209ENST00000441099 CUL7Q14999 1698 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC12-209ENST00000441099 JPH4Q96JJ6 628 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC12-209ENST00000441099 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.89■■□□□ 1.89
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