Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 snR13snR13 124 nt2.28□□□□□ -2.04
HEF3P53978 YJL070CYJL070C 2667 nt2.28□□□□□ -2.04
HEF3P53978 FKS1YLR342W 5631 nt2.28□□□□□ -2.05
HEF3P53978 HMRA1YCR097W 381 nt2.27□□□□□ -2.05
HEF3P53978 ATP17YDR377W 306 nt2.27□□□□□ -2.05
HEF3P53978 TWF1YGR080W 999 nt2.27□□□□□ -2.05
HEF3P53978 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.27□□□□□ -2.05
HEF3P53978 PTC5YOR090C 1719 nt2.27□□□□□ -2.05
HEF3P53978 REV1YOR346W 2958 nt2.26□□□□□ -2.05
HEF3P53978 HSC82YMR186W 2118 nt2.26□□□□□ -2.05
HEF3P53978 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.26□□□□□ -2.05
HEF3P53978 YDR157WYDR157W 402 nt2.26□□□□□ -2.05
HEF3P53978 ATP6Q0085 780 nt2.26□□□□□ -2.05
HEF3P53978 YFR056CYFR056C 369 nt2.26□□□□□ -2.05
HEF3P53978 CRG1YHR209W 876 nt2.26□□□□□ -2.05
HEF3P53978 UTP30YKR060W 825 nt2.26□□□□□ -2.05
HEF3P53978 COX7YMR256C 183 nt2.26□□□□□ -2.05
HEF3P53978 YOR392WYOR392W 444 nt2.26□□□□□ -2.05
HEF3P53978 YBR277CYBR277C 402 nt2.26□□□□□ -2.05
HEF3P53978 SPO23YBR250W 1572 nt2.26□□□□□ -2.05
HEF3P53978 NCL1YBL024W 2055 nt2.26□□□□□ -2.05
HEF3P53978 NIC96YFR002W 2520 nt2.25□□□□□ -2.05
HEF3P53978 MZM1YDR493W 372 nt2.25□□□□□ -2.05
HEF3P53978 TIM9YEL020W-A 264 nt2.25□□□□□ -2.05
HEF3P53978 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.25□□□□□ -2.05
HEF3P53978 SHE2YKL130C 741 nt2.25□□□□□ -2.05
HEF3P53978 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt2.25□□□□□ -2.05
HEF3P53978 LSM7YNL147W 348 nt2.25□□□□□ -2.05
HEF3P53978 CBF2YGR140W 2871 nt2.25□□□□□ -2.05
HEF3P53978 VPS52YDR484W 1926 nt2.25□□□□□ -2.05
HEF3P53978 SDC1YDR469W 528 nt2.24□□□□□ -2.05
HEF3P53978 IES5YER092W 378 nt2.24□□□□□ -2.05
HEF3P53978 YNL010WYNL010W 726 nt2.24□□□□□ -2.05
HEF3P53978 PRK1YIL095W 2433 nt2.23□□□□□ -2.05
HEF3P53978 MPH1YIR002C 2982 nt2.23□□□□□ -2.05
HEF3P53978 YEL043WYEL043W 2871 nt2.23□□□□□ -2.05
HEF3P53978 YDL041WYDL041W 354 nt2.23□□□□□ -2.05
HEF3P53978 FMP16YDR070C 282 nt2.23□□□□□ -2.05
HEF3P53978 BTT1YDR252W 450 nt2.23□□□□□ -2.05
HEF3P53978 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.23□□□□□ -2.05
HEF3P53978 YMR320WYMR320W 306 nt2.23□□□□□ -2.05
HEF3P53978 LEE1YPL054W 906 nt2.23□□□□□ -2.05
HEF3P53978 ROX1YPR065W 1107 nt2.23□□□□□ -2.05
HEF3P53978 YSW1YBR148W 1830 nt2.23□□□□□ -2.05
HEF3P53978 IRC10YOL015W 1761 nt2.23□□□□□ -2.05
HEF3P53978 VPS34YLR240W 2628 nt2.22□□□□□ -2.05
HEF3P53978 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.22□□□□□ -2.05
HEF3P53978 IPT1YDR072C 1584 nt2.21□□□□□ -2.06
HEF3P53978 YER079WYER079W 633 nt2.21□□□□□ -2.06
HEF3P53978 VOA1YGR106C 798 nt2.21□□□□□ -2.06
HEF3P53978 RRF1YHR038W 693 nt2.21□□□□□ -2.06
HEF3P53978 PAU8YAL068C 363 nt2.21□□□□□ -2.06
HEF3P53978 MSL5YLR116W 1431 nt2.21□□□□□ -2.06
HEF3P53978 YML084WYML084W 309 nt2.21□□□□□ -2.06
HEF3P53978 ZEO1YOL109W 342 nt2.21□□□□□ -2.06
HEF3P53978 YOL159CYOL159C 516 nt2.21□□□□□ -2.06
HEF3P53978 PAU20YOL161C 363 nt2.21□□□□□ -2.06
HEF3P53978 AFI1YOR129C 2682 nt2.21□□□□□ -2.06
HEF3P53978 NAN1YPL126W 2691 nt2.21□□□□□ -2.06
HEF3P53978 CFT1YDR301W 4074 nt2.21□□□□□ -2.06
HEF3P53978 SAC3YDR159W 3906 nt2.21□□□□□ -2.06
HEF3P53978 TOR2YKL203C 7425 nt2.2□□□□□ -2.06
HEF3P53978 MSS11YMR164C 2277 nt2.2□□□□□ -2.06
HEF3P53978 RTP1YMR185W 2946 nt2.2□□□□□ -2.06
HEF3P53978 snR79snR79 84 nt2.2□□□□□ -2.06
HEF3P53978 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt2.2□□□□□ -2.06
HEF3P53978 YDR269CYDR269C 324 nt2.2□□□□□ -2.06
HEF3P53978 ANS1YHR126C 480 nt2.2□□□□□ -2.06
HEF3P53978 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.2□□□□□ -2.06
HEF3P53978 GRX8YLR364W 330 nt2.2□□□□□ -2.06
HEF3P53978 YMR324CYMR324C 243 nt2.2□□□□□ -2.06
HEF3P53978 EGD1YPL037C 474 nt2.2□□□□□ -2.06
HEF3P53978 RGA1YOR127W 3024 nt2.2□□□□□ -2.06
HEF3P53978 RRP6YOR001W 2202 nt2.19□□□□□ -2.06
HEF3P53978 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt2.19□□□□□ -2.06
HEF3P53978 COX1Q0045 1605 nt2.19□□□□□ -2.06
HEF3P53978 USO1YDL058W 5373 nt2.18□□□□□ -2.06
HEF3P53978 SPC72YAL047C 1869 nt2.18□□□□□ -2.06
HEF3P53978 BFA1YJR053W 1725 nt2.18□□□□□ -2.06
HEF3P53978 snR56snR56 88 nt2.18□□□□□ -2.06
HEF3P53978 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.18□□□□□ -2.06
HEF3P53978 NFU1YKL040C 771 nt2.18□□□□□ -2.06
HEF3P53978 RPS17AYML024W 411 nt2.18□□□□□ -2.06
HEF3P53978 ERP4YOR016C 624 nt2.18□□□□□ -2.06
HEF3P53978 YPR012WYPR012W 255 nt2.18□□□□□ -2.06
HEF3P53978 LSO2YGR169C-A 279 nt2.17□□□□□ -2.06
HEF3P53978 NOP10YHR072W-A 177 nt2.17□□□□□ -2.06
HEF3P53978 SEC22YLR268W 645 nt2.17□□□□□ -2.06
HEF3P53978 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.17□□□□□ -2.06
HEF3P53978 RTC6YPL183W-A 282 nt2.17□□□□□ -2.06
HEF3P53978 YJR098CYJR098C 1971 nt2.17□□□□□ -2.06
HEF3P53978 ARP7YPR034W 1434 nt2.17□□□□□ -2.06
HEF3P53978 CDC50YCR094W 1176 nt2.16□□□□□ -2.06
HEF3P53978 SWF1YDR126W 1011 nt2.16□□□□□ -2.06
HEF3P53978 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.16□□□□□ -2.06
HEF3P53978 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt2.16□□□□□ -2.06
HEF3P53978 SOK2YMR016C 2358 nt2.16□□□□□ -2.06
HEF3P53978 KAR3YPR141C 2190 nt2.16□□□□□ -2.06
HEF3P53978 RBK1YCR036W 1002 nt2.15□□□□□ -2.07
HEF3P53978 SDH7YDR511W 402 nt2.15□□□□□ -2.07
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